55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_24250 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_24250  addiction module toxin, RelE/StbE family  100 
 
 
88 aa  174  4e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278684  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0735  hypothetical protein  54.88 
 
 
85 aa  105  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118152  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1978  hypothetical protein  53.66 
 
 
85 aa  104  5e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0193  toxin-antitoxin system, toxin component, RelE family  50.57 
 
 
88 aa  102  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2094  addiction module toxin, RelE/StbE family  54.65 
 
 
86 aa  99  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1376  addiction module antitoxin  54.65 
 
 
86 aa  95.9  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1292  toxin-like protein  56.32 
 
 
88 aa  95.5  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3231  hypothetical protein  50.57 
 
 
88 aa  94.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.73498  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1483  addiction module toxin, RelE/StbE family  44.05 
 
 
86 aa  94  7e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0031992  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1261  addiction module antitoxin  55.17 
 
 
88 aa  92.8  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1338  addiction module toxin, RelE/StbE family  52.33 
 
 
86 aa  92.4  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4390  addiction module antitoxin  48.86 
 
 
88 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1963  addiction module toxin, RelE/StbE family  46.59 
 
 
89 aa  90.9  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3569  addiction module toxin, RelE/StbE  50.56 
 
 
90 aa  90.5  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172224  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1617  addiction module antitoxin  49.43 
 
 
92 aa  87.8  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000591233  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1625  addiction module toxin, RelE/StbE family  47.73 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00126224  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0380  RelE/StbE family addiction module toxin  51.14 
 
 
89 aa  84  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2779  toxin-like protein  49.43 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000388867  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3196  plasmid stabilization system protein  42.05 
 
 
89 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2032  plasmid addiction system poison protein  41.77 
 
 
85 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0102565  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0326  plasmid stabilization system protein  34.52 
 
 
90 aa  60.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.495753  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1873  addiction module toxin, RelE/StbE  37.65 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.331501  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3715  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.08 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0628  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.21 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0751  plasmid stabilization system protein  36.05 
 
 
92 aa  54.7  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0158403  normal  0.887347 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1966  addiction module toxin, RelE/StbE  33.72 
 
 
85 aa  53.9  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0245113  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2275  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.72 
 
 
93 aa  53.5  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2099  addiction module antitoxin  34.88 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0664  plasmid stabilization system protein  36.78 
 
 
90 aa  52  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175853  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2497  plasmid stabilization system protein  31.4 
 
 
87 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3416  addiction module antitoxin  36.05 
 
 
89 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866915  normal  0.0981554 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1021  RelE protein  37.21 
 
 
83 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1940  plasmid stabilization system  40.48 
 
 
91 aa  50.1  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3992  plasmid stabilization system  32.18 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0288858  normal  0.818838 
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  27.17 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3300  addiction module antitoxin  43.24 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.991321  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0782  plasmid stabilization system  35.63 
 
 
85 aa  47.8  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00543713  normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0823  plasmid stabilization system  33.33 
 
 
87 aa  47.8  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.305872  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12882  hypothetical protein  34.44 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1039  addiction module antitoxin  30.59 
 
 
85 aa  47  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.584776  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1635  addiction module antitoxin  31.71 
 
 
84 aa  47  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.537799  hitchhiker  0.001685 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2458  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.37 
 
 
84 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000245877  unclonable  0.000000000270671 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1272  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.63 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1817  addiction module antitoxin  36.84 
 
 
84 aa  45.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0467735  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11272  hypothetical protein  34.52 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00225082  hitchhiker  0.00711105 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0239  plasmid stabilization system  33.33 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0375535  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1442  hypothetical protein  46 
 
 
59 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0362351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7793  toxin-like protein  43.14 
 
 
91 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0773  plasmid stabilization system  40.7 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0847  plasmid stabilization system  32.14 
 
 
91 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0471  addiction module toxin, RelE/StbE family  27.38 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000228475  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2100  plasmid stabilization system  42.31 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.60445 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2000  hypothetical protein  36.05 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23181  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0985  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.12 
 
 
85 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1777  cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  38.78 
 
 
98 aa  40  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>