52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2779 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2779  toxin-like protein  100 
 
 
88 aa  176  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000388867  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1376  addiction module antitoxin  57.95 
 
 
86 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3196  plasmid stabilization system protein  55.06 
 
 
89 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3231  hypothetical protein  53.41 
 
 
88 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.73498  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2094  addiction module toxin, RelE/StbE family  54.55 
 
 
86 aa  101  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1625  addiction module toxin, RelE/StbE family  50.56 
 
 
90 aa  99.4  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00126224  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0380  RelE/StbE family addiction module toxin  53.93 
 
 
89 aa  98.6  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1617  addiction module antitoxin  48.86 
 
 
92 aa  98.2  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000591233  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1338  addiction module toxin, RelE/StbE family  54.55 
 
 
86 aa  96.7  9e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3569  addiction module toxin, RelE/StbE  47.73 
 
 
90 aa  90.9  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172224  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4390  addiction module antitoxin  45.98 
 
 
88 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24250  addiction module toxin, RelE/StbE family  49.43 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278684  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1261  addiction module antitoxin  48.86 
 
 
88 aa  82  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1292  toxin-like protein  48.86 
 
 
88 aa  82  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1483  addiction module toxin, RelE/StbE family  45.24 
 
 
86 aa  79.7  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0031992  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0193  toxin-antitoxin system, toxin component, RelE family  37.93 
 
 
88 aa  77  0.00000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0735  hypothetical protein  40 
 
 
85 aa  71.2  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118152  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1978  hypothetical protein  40 
 
 
85 aa  70.9  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0326  plasmid stabilization system protein  31.76 
 
 
90 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.495753  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1966  addiction module toxin, RelE/StbE  35.23 
 
 
85 aa  62.4  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0245113  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1963  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.18 
 
 
89 aa  62  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2032  plasmid addiction system poison protein  35.37 
 
 
85 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0102565  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0985  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.63 
 
 
85 aa  55.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0239  plasmid stabilization system  33.33 
 
 
97 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0375535  n/a   
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.63 
 
 
92 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12882  hypothetical protein  32.95 
 
 
87 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2458  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.71 
 
 
84 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000245877  unclonable  0.000000000270671 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1940  plasmid stabilization system  39.44 
 
 
91 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7793  toxin-like protein  34.48 
 
 
91 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1777  cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  34.67 
 
 
98 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0847  plasmid stabilization system  31.4 
 
 
91 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2644  plasmid stabilization system  32.56 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2497  plasmid stabilization system protein  34.83 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1039  addiction module antitoxin  29.89 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.584776  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0628  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.95 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2680  plasmid stabilization system protein  33.72 
 
 
98 aa  47  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0338325  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1873  addiction module toxin, RelE/StbE  34.85 
 
 
92 aa  47  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.331501  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1272  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.21 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3376  addiction module antitoxin  32.22 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0812  plasmid stabilization system protein  31.52 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00582411  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3300  addiction module antitoxin  33.33 
 
 
87 aa  42.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.991321  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1021  RelE protein  29.55 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1635  addiction module antitoxin  33.33 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.537799  hitchhiker  0.001685 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11272  hypothetical protein  34.62 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00225082  hitchhiker  0.00711105 
 
 
-
 
NC_002978  WD0126  hypothetical protein  29.58 
 
 
90 aa  42.7  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4546  addiction module antitoxin  32.97 
 
 
95 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.747035  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0122  hypothetical protein  23.17 
 
 
91 aa  41.6  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0089  hypothetical protein  27.06 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.735538  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3715  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.03 
 
 
89 aa  41.2  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2746  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.07 
 
 
106 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0823  plasmid stabilization system  28.74 
 
 
87 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.305872  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0751  plasmid stabilization system protein  24.18 
 
 
92 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0158403  normal  0.887347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>