64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_A3569 on replicon NC_007515
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007515  Gmet_A3569  addiction module toxin, RelE/StbE  100 
 
 
90 aa  177  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172224  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3196  plasmid stabilization system protein  70.45 
 
 
89 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1625  addiction module toxin, RelE/StbE family  67.05 
 
 
90 aa  124  5e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00126224  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0380  RelE/StbE family addiction module toxin  56.82 
 
 
89 aa  107  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4390  addiction module antitoxin  49.44 
 
 
88 aa  94.4  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2094  addiction module toxin, RelE/StbE family  52.27 
 
 
86 aa  94  6e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3231  hypothetical protein  48.86 
 
 
88 aa  94  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.73498  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0326  plasmid stabilization system protein  48.24 
 
 
90 aa  93.2  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.495753  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2779  toxin-like protein  47.73 
 
 
88 aa  90.9  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000388867  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24250  addiction module toxin, RelE/StbE family  50.56 
 
 
88 aa  90.5  8e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278684  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1376  addiction module antitoxin  51.14 
 
 
86 aa  89.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1617  addiction module antitoxin  46.67 
 
 
92 aa  88.2  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000591233  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1338  addiction module toxin, RelE/StbE family  47.73 
 
 
86 aa  84.3  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1261  addiction module antitoxin  46.59 
 
 
88 aa  80.5  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1963  addiction module toxin, RelE/StbE family  40 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1292  toxin-like protein  46.59 
 
 
88 aa  79.7  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0735  hypothetical protein  48.24 
 
 
85 aa  77.8  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118152  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1483  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.53 
 
 
86 aa  76.3  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0031992  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1978  hypothetical protein  47.06 
 
 
85 aa  76.6  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0193  toxin-antitoxin system, toxin component, RelE family  40 
 
 
88 aa  75.9  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.25 
 
 
92 aa  60.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3715  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.33 
 
 
89 aa  60.1  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0664  plasmid stabilization system protein  35.56 
 
 
90 aa  58.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175853  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0751  plasmid stabilization system protein  34.44 
 
 
92 aa  57.8  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0158403  normal  0.887347 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0773  plasmid stabilization system  40.91 
 
 
84 aa  57.4  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2032  plasmid addiction system poison protein  37.97 
 
 
85 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0102565  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12882  hypothetical protein  34.44 
 
 
87 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2458  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.05 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000245877  unclonable  0.000000000270671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2497  plasmid stabilization system protein  35.16 
 
 
87 aa  50.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2099  addiction module antitoxin  41.11 
 
 
85 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1021  RelE protein  35.56 
 
 
83 aa  50.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1039  addiction module antitoxin  34.48 
 
 
85 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.584776  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1873  addiction module toxin, RelE/StbE  32.95 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.331501  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1966  addiction module toxin, RelE/StbE  26.97 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0245113  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3376  addiction module antitoxin  35.16 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0089  hypothetical protein  31.18 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.735538  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2100  plasmid stabilization system  44.26 
 
 
85 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.60445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3416  addiction module antitoxin  34.09 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866915  normal  0.0981554 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0628  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.44 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1272  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.03 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4546  addiction module antitoxin  34.88 
 
 
95 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.747035  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1619  putative stability protein StbE  34.52 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.476443  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1655  putative stability protein StbE  34.52 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1940  plasmid stabilization system  33.72 
 
 
91 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0823  plasmid stabilization system  38.57 
 
 
87 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.305872  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2644  plasmid stabilization system  31.4 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1721  putative stability protein StbE  33.33 
 
 
94 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165239  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0387  hypothetical protein  32.61 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0319  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.95 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0691287  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0794  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.385271  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3300  addiction module antitoxin  44.44 
 
 
87 aa  42.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.991321  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0600  hypothetical protein  33.77 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152122  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1635  addiction module antitoxin  26.83 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.537799  hitchhiker  0.001685 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3849  addiction module antitoxin  29.67 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000246767 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0812  plasmid stabilization system protein  28.41 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00582411  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0471  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.67 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000228475  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11272  hypothetical protein  26.74 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00225082  hitchhiker  0.00711105 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0779  addiction module antitoxin  48.57 
 
 
70 aa  41.6  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0823  hypothetical protein  31.52 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.382841  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2679  plasmid stabilization system protein  27.59 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0131274  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0473  addiction module toxin, RelE/StbE family  27.78 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000210818  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1469  putative plasmid stabilisation system protein  29.35 
 
 
94 aa  40.4  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.165331  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2645  plasmid stabilization system  43.08 
 
 
84 aa  40  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0214244 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1817  addiction module antitoxin  34.18 
 
 
84 aa  40  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0467735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>