23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2679 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2679  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 95 aa  190  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0131274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7793  toxin-like protein  56.82 
 
 		 91 aa  87  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0847  plasmid stabilization system  52.81 
 
 		 91 aa  79  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2644  plasmid stabilization system  46.74 
 
 		 96 aa  77  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0239  plasmid stabilization system  53.66 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0375535  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3586  hypothetical protein  43.53 
 
 		 94 aa  69.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11272  hypothetical protein  48.28 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00225082  hitchhiker  0.00711105 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1940  plasmid stabilization system  42.7 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12882  hypothetical protein  45.98 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2680  plasmid stabilization system protein  45.88 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0338325  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2333  plasmid stabilization system protein  39.13 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal  0.927258 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3209  hypothetical protein  50 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.133986 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1966  addiction module toxin, RelE/StbE  36.36 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0245113  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0404  hypothetical protein  36.11 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.111449  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2497  plasmid stabilization system protein  36.36 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0628  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.89 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1625  addiction module toxin, RelE/StbE family  26.14 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00126224  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1376  addiction module antitoxin  33.72 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1039  addiction module antitoxin  32.18 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.584776  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3992  plasmid stabilization system  35.29 
 
 		 87 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0288858  normal  0.818838 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3569  addiction module toxin, RelE/StbE  27.59 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172224  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1338  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.72 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2094  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.07 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>