52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12882 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12882  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2644  plasmid stabilization system  54.12 
 
 
96 aa  92.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11272  hypothetical protein  54.12 
 
 
97 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00225082  hitchhiker  0.00711105 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1940  plasmid stabilization system  46.43 
 
 
91 aa  79.7  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0239  plasmid stabilization system  48.81 
 
 
97 aa  78.2  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0375535  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7793  toxin-like protein  50.59 
 
 
91 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0847  plasmid stabilization system  44.71 
 
 
91 aa  74.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2333  plasmid stabilization system protein  47.06 
 
 
93 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal  0.927258 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2680  plasmid stabilization system protein  46.51 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0338325  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2679  plasmid stabilization system protein  45.98 
 
 
95 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0131274  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2094  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.4 
 
 
86 aa  56.6  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1039  addiction module antitoxin  35.71 
 
 
85 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.584776  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3569  addiction module toxin, RelE/StbE  34.44 
 
 
90 aa  54.3  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172224  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0823  plasmid stabilization system  32.56 
 
 
87 aa  54.3  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.305872  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1376  addiction module antitoxin  31.4 
 
 
86 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3586  hypothetical protein  38.1 
 
 
94 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7921  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2099  addiction module antitoxin  33.72 
 
 
85 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2779  toxin-like protein  32.95 
 
 
88 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000388867  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1338  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.4 
 
 
86 aa  50.8  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1966  addiction module toxin, RelE/StbE  27.91 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0245113  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3209  hypothetical protein  40.98 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.133986 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1963  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.58 
 
 
89 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.11 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0122  hypothetical protein  33.33 
 
 
91 aa  48.1  0.00004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0404  hypothetical protein  30.59 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.111449  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24250  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.44 
 
 
88 aa  47.4  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278684  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2497  plasmid stabilization system protein  34.48 
 
 
87 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1483  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.76 
 
 
86 aa  46.2  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0031992  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1625  addiction module toxin, RelE/StbE family  26.67 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00126224  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2275  addiction module toxin, RelE/StbE family  26.44 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1978  hypothetical protein  32.53 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0735  hypothetical protein  32.53 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118152  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1617  addiction module antitoxin  30.34 
 
 
92 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000591233  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3231  hypothetical protein  26.97 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.73498  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1850  plasmid stabilization system protein  36.25 
 
 
92 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0340045 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3196  plasmid stabilization system protein  30.34 
 
 
89 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0600  hypothetical protein  36.49 
 
 
93 aa  43.9  0.0008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152122  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2032  plasmid addiction system poison protein  33.33 
 
 
85 aa  43.9  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0102565  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0628  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.89 
 
 
85 aa  43.5  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0782  plasmid stabilization system  27.59 
 
 
85 aa  43.5  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00543713  normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1817  addiction module antitoxin  37.35 
 
 
84 aa  42.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0467735  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1873  addiction module toxin, RelE/StbE  31.03 
 
 
92 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.331501  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1261  addiction module antitoxin  32.95 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0380  RelE/StbE family addiction module toxin  32.58 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3715  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.23 
 
 
89 aa  42  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3064  hypothetical protein  33.75 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1292  toxin-like protein  32.95 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3992  plasmid stabilization system  32.53 
 
 
87 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0288858  normal  0.818838 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4390  addiction module antitoxin  26.44 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0269  hypothetical protein  31.11 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0387  hypothetical protein  28.24 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2645  plasmid stabilization system  32.94 
 
 
84 aa  40.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0214244 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>