38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3992 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3992  plasmid stabilization system  100 
 
 		 87 aa  174  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0288858  normal  0.818838 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2497  plasmid stabilization system protein  48.78 
 
 		 87 aa  73.9  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3715  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.86 
 
 		 89 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2100  plasmid stabilization system  44.58 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.60445 
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.07 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2645  plasmid stabilization system  42.68 
 
 		 84 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0214244 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0823  plasmid stabilization system  40.24 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.305872  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2099  addiction module antitoxin  39.76 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1039  addiction module antitoxin  36.59 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.584776  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3300  addiction module antitoxin  39.76 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.991321  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0847  plasmid stabilization system  32.94 
 
 		 91 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7793  toxin-like protein  39.33 
 
 		 91 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0782  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 85 aa  51.2  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00543713  normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0473  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.14 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000210818  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24250  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.18 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2458  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.71 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000245877  unclonable  0.000000000270671 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1966  addiction module toxin, RelE/StbE  34.88 
 
 		 85 aa  48.1  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0245113  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2333  plasmid stabilization system protein  36.05 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal  0.927258 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3073  plasmid stabilization system protein  27.59 
 
 		 83 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.2431  normal  0.0660854 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3192  plasmid stabilization system  30.23 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0534  hypothetical protein  35.44 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00558878  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2680  plasmid stabilization system protein  38.64 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0338325  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0773  plasmid stabilization system  30.38 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1978  hypothetical protein  33.73 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0779  addiction module antitoxin  45.1 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1648  hypothetical protein  33.33 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0597256  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0628  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.94 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1017  plasmid stabilization system protein  29.55 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000594765  unclonable  0.00000000272717 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1442  hypothetical protein  37.74 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0362351 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1272  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.88 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12882  hypothetical protein  32.53 
 
 		 87 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2679  plasmid stabilization system protein  35.29 
 
 		 95 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0131274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0812  plasmid stabilization system protein  29.76 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00582411  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0433  hypothetical protein  30.59 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.615805  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0735  hypothetical protein  33.33 
 
 		 85 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118152  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3279  hypothetical protein  31.51 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.741778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  34.78 
 
 		 712 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1021  RelE protein  32.53 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>