36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3073 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3073  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 83 aa  166  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.2431  normal  0.0660854 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0603  plasmid stabilization system  51.22 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.837316  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4070  plasmid stabilization system protein  50 
 
 		 80 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4743  plasmid stabilization system  39.02 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.786175  normal  0.0196612 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1039  plasmid stabilization system  47.22 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358287 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2000  hypothetical protein  32.53 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23181  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2268  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 201 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1817  addiction module antitoxin  35.44 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0467735  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2414  plasmid stabilization system protein  45.83 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.496322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1021  RelE protein  36.71 
 
 		 83 aa  51.2  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3025  hypothetical protein  63.64 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6628  hypothetical protein  38.55 
 
 		 82 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.273077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3171  hypothetical protein  58.14 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00924455  normal  0.507561 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2944  hypothetical protein  58.14 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110723 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3192  plasmid stabilization system  40 
 
 		 86 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3715  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.15 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1680  hypothetical protein  41.67 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.521078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3992  plasmid stabilization system  27.59 
 
 		 87 aa  47  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0288858  normal  0.818838 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0782  plasmid stabilization system  43.28 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00543713  normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  27.27 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0985  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.49 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1469  putative plasmid stabilisation system protein  30.95 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.165331  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2458  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.15 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000245877  unclonable  0.000000000270671 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0823  hypothetical protein  28.21 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.382841  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1635  addiction module antitoxin  52.27 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.537799  hitchhiker  0.001685 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2439  RelE protein  27.5 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193835  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2497  plasmid stabilization system protein  28.4 
 
 		 87 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1619  putative stability protein StbE  25.68 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.476443  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1655  putative stability protein StbE  25.68 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0018  toxin RelE  29.33 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2072  addiction module antitoxin  29.33 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0473  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.25 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000210818  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1777  cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  40.38 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2079  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.33 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00218718  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1721  putative stability protein StbE  24.32 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0773  plasmid stabilization system  26.58 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>