49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0773 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0773  plasmid stabilization system  100 
 
 
84 aa  166  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3715  addiction module toxin, RelE/StbE family  50.6 
 
 
89 aa  82.4  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2100  plasmid stabilization system  46.99 
 
 
85 aa  67  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.60445 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2099  addiction module antitoxin  47.06 
 
 
85 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.56 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3300  addiction module antitoxin  40.96 
 
 
87 aa  63.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.991321  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1442  hypothetical protein  59.26 
 
 
59 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0362351 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0779  addiction module antitoxin  50.98 
 
 
70 aa  60.8  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2497  plasmid stabilization system protein  37.65 
 
 
87 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0823  plasmid stabilization system  35 
 
 
87 aa  60.5  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.305872  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2645  plasmid stabilization system  47.44 
 
 
84 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0214244 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1039  addiction module antitoxin  37.5 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.584776  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0628  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.1 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3569  addiction module toxin, RelE/StbE  40.91 
 
 
90 aa  57.4  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172224  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4390  addiction module antitoxin  38.64 
 
 
88 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2094  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.23 
 
 
86 aa  53.5  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1376  addiction module antitoxin  40.23 
 
 
86 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1483  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.95 
 
 
86 aa  49.7  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0031992  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1021  RelE protein  36.59 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1338  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.93 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0985  addiction module toxin, RelE/StbE family  44.44 
 
 
85 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1625  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.44 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00126224  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1966  addiction module toxin, RelE/StbE  32.14 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0245113  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3196  plasmid stabilization system protein  37.36 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0473  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.14 
 
 
84 aa  47.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000210818  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0089  hypothetical protein  26.19 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.735538  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3992  plasmid stabilization system  30.38 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0288858  normal  0.818838 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3231  hypothetical protein  35.96 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.73498  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3688  addiction module antitoxin  28.4 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125211  normal  0.144102 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0664  plasmid stabilization system protein  30.68 
 
 
90 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175853  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2439  RelE protein  28.4 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193835  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4716  addiction module toxin RelE  29.63 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0380  RelE/StbE family addiction module toxin  40 
 
 
89 aa  45.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0751  plasmid stabilization system protein  35.9 
 
 
92 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0158403  normal  0.887347 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24250  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.7 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278684  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3416  addiction module antitoxin  31.76 
 
 
89 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866915  normal  0.0981554 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0812  plasmid stabilization system protein  30.95 
 
 
84 aa  43.9  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00582411  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3785  stability protein StbE  28.4 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0782  plasmid stabilization system  31.75 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00543713  normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0435  addiction module antitoxin  26.19 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1635  addiction module antitoxin  34.15 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.537799  hitchhiker  0.001685 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1617  addiction module antitoxin  35.96 
 
 
92 aa  41.6  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000591233  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1032  plasmid stabilization system  29.76 
 
 
87 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.45088e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0326  plasmid stabilization system protein  38.37 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.495753  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0244  addiction module toxin, RelE/StbE family  27.16 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0600  hypothetical protein  34.62 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152122  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3073  plasmid stabilization system protein  26.58 
 
 
83 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.2431  normal  0.0660854 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5382  addiction module antitoxin  29.63 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.584673 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3376  addiction module antitoxin  27.38 
 
 
88 aa  40  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>