72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2099 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2099  addiction module antitoxin  100 
 
 
85 aa  167  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.96 
 
 
92 aa  79.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3715  addiction module toxin, RelE/StbE family  47.62 
 
 
89 aa  75.5  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1039  addiction module antitoxin  45.78 
 
 
85 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.584776  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2497  plasmid stabilization system protein  43.53 
 
 
87 aa  73.2  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3300  addiction module antitoxin  47.62 
 
 
87 aa  68.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.991321  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2645  plasmid stabilization system  48.19 
 
 
84 aa  67  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0214244 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0773  plasmid stabilization system  47.06 
 
 
84 aa  66.6  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0823  plasmid stabilization system  42.17 
 
 
87 aa  66.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.305872  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2100  plasmid stabilization system  47.62 
 
 
85 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.60445 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2094  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.7 
 
 
86 aa  64.3  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0782  plasmid stabilization system  34.12 
 
 
85 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00543713  normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0985  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.35 
 
 
85 aa  62.4  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3992  plasmid stabilization system  39.76 
 
 
87 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0288858  normal  0.818838 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1376  addiction module antitoxin  38.37 
 
 
86 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0664  plasmid stabilization system protein  40.91 
 
 
90 aa  60.1  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175853  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1338  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.05 
 
 
86 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0193  toxin-antitoxin system, toxin component, RelE family  38.37 
 
 
88 aa  58.5  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0628  addiction module toxin, RelE/StbE family  40 
 
 
85 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1625  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.78 
 
 
90 aa  57.4  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00126224  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3192  plasmid stabilization system  35.37 
 
 
86 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2458  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.62 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000245877  unclonable  0.000000000270671 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24250  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.88 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278684  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1978  hypothetical protein  39.51 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0735  hypothetical protein  40.74 
 
 
85 aa  52.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118152  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0779  addiction module antitoxin  44.64 
 
 
70 aa  52  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1021  RelE protein  38.82 
 
 
83 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2275  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.21 
 
 
93 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12882  hypothetical protein  33.72 
 
 
87 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1963  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.23 
 
 
89 aa  51.2  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3569  addiction module toxin, RelE/StbE  41.11 
 
 
90 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172224  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1442  hypothetical protein  42.59 
 
 
59 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0362351 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3025  hypothetical protein  39.39 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3231  hypothetical protein  32.29 
 
 
88 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.73498  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0387  hypothetical protein  32.94 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0380  RelE/StbE family addiction module toxin  37.08 
 
 
89 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1635  addiction module antitoxin  33.33 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.537799  hitchhiker  0.001685 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0823  hypothetical protein  29.55 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.382841  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3196  plasmid stabilization system protein  36.67 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0122  hypothetical protein  37.04 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0812  plasmid stabilization system protein  34.12 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00582411  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1617  addiction module antitoxin  41.11 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000591233  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0126  hypothetical protein  37.21 
 
 
90 aa  47.8  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1469  putative plasmid stabilisation system protein  29.21 
 
 
94 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.165331  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1966  addiction module toxin, RelE/StbE  33.72 
 
 
85 aa  47.8  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0245113  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0473  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.44 
 
 
84 aa  47.4  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000210818  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0269  hypothetical protein  35 
 
 
102 aa  47.4  0.00008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1873  addiction module toxin, RelE/StbE  37.65 
 
 
92 aa  47  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.331501  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1817  addiction module antitoxin  30.77 
 
 
84 aa  47  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0467735  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2644  plasmid stabilization system  35.71 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0404  hypothetical protein  34.88 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.111449  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4390  addiction module antitoxin  34.09 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  37.84 
 
 
712 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2569  plasmid stabilization system protein  34.88 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1261  addiction module antitoxin  35.96 
 
 
88 aa  44.7  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1292  toxin-like protein  35.96 
 
 
88 aa  44.3  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1956  plasmid stabilization system protein  41.86 
 
 
70 aa  43.9  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000296244  n/a   
 
 
 
NC_007614  Nmul_A0326  plasmid stabilization system protein  38.82 
 
 
90 aa  43.9  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.495753  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1787  hypothetical protein  45.45 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  36.84 
 
 
697 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1483  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0031992  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3416  addiction module antitoxin  30.95 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866915  normal  0.0981554 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1032  plasmid stabilization system  29.76 
 
 
87 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.45088e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2944  hypothetical protein  34.78 
 
 
68 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110723 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3171  hypothetical protein  34.78 
 
 
68 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00924455  normal  0.507561 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3849  addiction module antitoxin  26.97 
 
 
103 aa  41.6  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000246767 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11272  hypothetical protein  32.94 
 
 
97 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00225082  hitchhiker  0.00711105 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2259  UvrD/REP helicase  35.37 
 
 
710 aa  41.2  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0960519  normal 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4161  plasmid stabilization system  27.66 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4655  hypothetical protein  39.66 
 
 
93 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0600  hypothetical protein  47.22 
 
 
93 aa  40.8  0.007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152122  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0239  plasmid stabilization system  35.29 
 
 
97 aa  40.8  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0375535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>