57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1817 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1817  addiction module antitoxin  100 
 
 
84 aa  170  5.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0467735  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1021  RelE protein  36.14 
 
 
83 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1777  cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  38.03 
 
 
98 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2000  hypothetical protein  30.49 
 
 
83 aa  54.3  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23181  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0985  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.18 
 
 
85 aa  54.7  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0603  plasmid stabilization system  39.51 
 
 
103 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.837316  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3073  plasmid stabilization system protein  35.44 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.2431  normal  0.0660854 
 
 
-
 
NC_002978  WD0122  hypothetical protein  36 
 
 
91 aa  51.6  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.34 
 
 
92 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1376  addiction module antitoxin  35.29 
 
 
86 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2094  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.29 
 
 
86 aa  51.2  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3231  hypothetical protein  33.33 
 
 
88 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.73498  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0473  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.57 
 
 
84 aa  50.8  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000210818  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4743  plasmid stabilization system  28.92 
 
 
86 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.786175  normal  0.0196612 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0751  plasmid stabilization system protein  34.48 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0158403  normal  0.887347 
 
 
-
 
NC_002978  WD0404  hypothetical protein  33.78 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.111449  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0126  hypothetical protein  33.33 
 
 
90 aa  49.7  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1338  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.29 
 
 
86 aa  48.9  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1966  addiction module toxin, RelE/StbE  32.94 
 
 
85 aa  48.9  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0245113  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2497  plasmid stabilization system protein  28.57 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0782  plasmid stabilization system  35.29 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00543713  normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2458  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.5 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000245877  unclonable  0.000000000270671 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0735  hypothetical protein  32.94 
 
 
85 aa  48.1  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118152  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4390  addiction module antitoxin  37.8 
 
 
88 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1625  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.71 
 
 
90 aa  47.8  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00126224  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2099  addiction module antitoxin  30.77 
 
 
85 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1617  addiction module antitoxin  30.49 
 
 
92 aa  47  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000591233  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4070  plasmid stabilization system protein  34.57 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1978  hypothetical protein  30.59 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24250  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.84 
 
 
88 aa  45.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278684  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0812  plasmid stabilization system protein  30.49 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00582411  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1963  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.59 
 
 
89 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1472  plasmid stabilization system protein  32.94 
 
 
86 aa  45.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1287  hypothetical protein  62.5 
 
 
60 aa  44.7  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2414  plasmid stabilization system protein  34.18 
 
 
83 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.496322  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2275  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.07 
 
 
93 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0433  hypothetical protein  29.07 
 
 
89 aa  43.5  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.615805  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12882  hypothetical protein  37.35 
 
 
87 aa  42.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0269  hypothetical protein  32 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2268  XRE family transcriptional regulator  29.87 
 
 
201 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1272  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.36 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0600  hypothetical protein  32.43 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152122  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0823  plasmid stabilization system  30.68 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.305872  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3416  addiction module antitoxin  47.73 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866915  normal  0.0981554 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1880  hypothetical protein  34.38 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0380  RelE/StbE family addiction module toxin  32.95 
 
 
89 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3196  plasmid stabilization system protein  34.18 
 
 
89 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3715  addiction module toxin, RelE/StbE family  26.83 
 
 
89 aa  41.6  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1956  plasmid stabilization system protein  28.57 
 
 
70 aa  41.6  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000296244  n/a   
 
 
 
NC_014150  Bmur_1483  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0031992  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3025  hypothetical protein  53.33 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  28.05 
 
 
712 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1873  addiction module toxin, RelE/StbE  28.24 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.331501  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3171  hypothetical protein  34.33 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00924455  normal  0.507561 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2944  hypothetical protein  34.33 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110723 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3209  hypothetical protein  47.06 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.133986 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3569  addiction module toxin, RelE/StbE  34.18 
 
 
90 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>