41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2644 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2644  plasmid stabilization system  100 
 
 		 96 aa  189  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0239  plasmid stabilization system  51.58 
 
 		 97 aa  105  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0375535  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11272  hypothetical protein  55.29 
 
 		 97 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00225082  hitchhiker  0.00711105 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12882  hypothetical protein  54.12 
 
 		 87 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7793  toxin-like protein  50 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0847  plasmid stabilization system  49.41 
 
 		 91 aa  78.2  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2679  plasmid stabilization system protein  46.74 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0131274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3209  hypothetical protein  54.84 
 
 		 63 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.133986 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1940  plasmid stabilization system  44.32 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2333  plasmid stabilization system protein  44.71 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal  0.927258 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2680  plasmid stabilization system protein  46.24 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0338325  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2094  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.14 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1376  addiction module antitoxin  33.33 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1039  addiction module antitoxin  38.37 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.584776  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0735  hypothetical protein  34.52 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118152  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3586  hypothetical protein  40.48 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1338  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.76 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2779  toxin-like protein  32.56 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000388867  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1966  addiction module toxin, RelE/StbE  29.76 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0245113  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1978  hypothetical protein  33.33 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2099  addiction module antitoxin  35.71 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0122  hypothetical protein  31.76 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1617  addiction module antitoxin  30.23 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000591233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3569  addiction module toxin, RelE/StbE  31.4 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172224  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1625  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.41 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00126224  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1483  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.12 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0031992  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3416  addiction module antitoxin  33.33 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866915  normal  0.0981554 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4390  addiction module antitoxin  27.06 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1873  addiction module toxin, RelE/StbE  29.89 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.331501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3231  hypothetical protein  29.55 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.73498  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0628  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.42 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0126  hypothetical protein  31.51 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1850  plasmid stabilization system protein  30.86 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0340045 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3064  hypothetical protein  31.08 
 
 		 105 aa  41.2  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2275  addiction module toxin, RelE/StbE family  26.74 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.57 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0823  plasmid stabilization system  29.35 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.305872  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1261  addiction module antitoxin  29.07 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3196  plasmid stabilization system protein  32.18 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0380  RelE/StbE family addiction module toxin  29.89 
 
 		 89 aa  40.4  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1292  toxin-like protein  29.07 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>