64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1978 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1978  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  172  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0735  hypothetical protein  94.12 
 
 
85 aa  163  8e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118152  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24250  addiction module toxin, RelE/StbE family  53.66 
 
 
88 aa  104  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278684  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1483  addiction module toxin, RelE/StbE family  57.14 
 
 
86 aa  100  8e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0031992  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2032  plasmid addiction system poison protein  53.33 
 
 
85 aa  92  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0102565  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0193  toxin-antitoxin system, toxin component, RelE family  50.6 
 
 
88 aa  89.7  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1261  addiction module antitoxin  50.62 
 
 
88 aa  88.2  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1292  toxin-like protein  50.62 
 
 
88 aa  87.8  5e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4390  addiction module antitoxin  51.25 
 
 
88 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1963  addiction module toxin, RelE/StbE family  47.5 
 
 
89 aa  85.5  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3231  hypothetical protein  46.91 
 
 
88 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.73498  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2094  addiction module toxin, RelE/StbE family  44.44 
 
 
86 aa  82  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1376  addiction module antitoxin  39.29 
 
 
86 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1338  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.65 
 
 
86 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3569  addiction module toxin, RelE/StbE  47.06 
 
 
90 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172224  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1625  addiction module toxin, RelE/StbE family  45.35 
 
 
90 aa  75.9  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00126224  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1617  addiction module antitoxin  45.68 
 
 
92 aa  75.1  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000591233  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0380  RelE/StbE family addiction module toxin  44.87 
 
 
89 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2779  toxin-like protein  40 
 
 
88 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000388867  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3196  plasmid stabilization system protein  44.19 
 
 
89 aa  70.5  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1966  addiction module toxin, RelE/StbE  35.71 
 
 
85 aa  60.8  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0245113  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1873  addiction module toxin, RelE/StbE  44.64 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.331501  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2680  plasmid stabilization system protein  38.1 
 
 
98 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0338325  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0326  plasmid stabilization system protein  35.8 
 
 
90 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.495753  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0628  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.51 
 
 
85 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7793  toxin-like protein  36.59 
 
 
91 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2497  plasmid stabilization system protein  39.51 
 
 
87 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3300  addiction module antitoxin  45.12 
 
 
87 aa  55.1  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.991321  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0751  plasmid stabilization system protein  34.62 
 
 
92 aa  54.3  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0158403  normal  0.887347 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1940  plasmid stabilization system  33.73 
 
 
91 aa  54.3  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0823  plasmid stabilization system  42.68 
 
 
87 aa  52.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.305872  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2100  plasmid stabilization system  50.82 
 
 
85 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.60445 
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.41 
 
 
92 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3715  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.94 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2099  addiction module antitoxin  39.51 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0122  hypothetical protein  35.8 
 
 
91 aa  49.7  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1635  addiction module antitoxin  36.14 
 
 
84 aa  49.7  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.537799  hitchhiker  0.001685 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2275  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.03 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1272  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.33 
 
 
86 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11272  hypothetical protein  33.73 
 
 
97 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00225082  hitchhiker  0.00711105 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0985  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.12 
 
 
85 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2644  plasmid stabilization system  33.33 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1442  hypothetical protein  38.89 
 
 
59 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0362351 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0664  plasmid stabilization system protein  35.29 
 
 
90 aa  47.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175853  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3416  addiction module antitoxin  35.53 
 
 
89 aa  47  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866915  normal  0.0981554 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1357  addiction module antitoxin  38.37 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.753541  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0471  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.33 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000228475  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0779  addiction module antitoxin  35.82 
 
 
70 aa  47  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2458  addiction module toxin, RelE/StbE family  27.38 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000245877  unclonable  0.000000000270671 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0812  plasmid stabilization system protein  37.33 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00582411  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12882  hypothetical protein  32.53 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1817  addiction module antitoxin  30.59 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0467735  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1956  plasmid stabilization system protein  32 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000296244  n/a   
 
 
 
NC_009455  DehaBAV1_1039  addiction module antitoxin  36.36 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.584776  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1021  RelE protein  34.52 
 
 
83 aa  45.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0473  addiction module toxin, RelE/StbE family  36 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000210818  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0269  hypothetical protein  30.86 
 
 
102 aa  45.4  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3992  plasmid stabilization system  33.73 
 
 
87 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0288858  normal  0.818838 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1777  cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  32.43 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0847  plasmid stabilization system  26.19 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2645  plasmid stabilization system  34.12 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0214244 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0239  plasmid stabilization system  25 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0375535  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5649  hypothetical protein  32.22 
 
 
94 aa  40.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0600  hypothetical protein  32 
 
 
93 aa  40.4  0.009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>