75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3715 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3715  addiction module toxin, RelE/StbE family  100 
 
 		 89 aa  173  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0773  plasmid stabilization system  50.6 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2497  plasmid stabilization system protein  41.38 
 
 		 87 aa  77.8  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2099  addiction module antitoxin  47.62 
 
 		 85 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3992  plasmid stabilization system  42.86 
 
 		 87 aa  72.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0288858  normal  0.818838 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0628  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.68 
 
 		 85 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0823  plasmid stabilization system  40.24 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.305872  n/a   
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.52 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1963  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.33 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0326  plasmid stabilization system protein  45.88 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.495753  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2100  plasmid stabilization system  44.58 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.60445 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2094  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.65 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0779  addiction module antitoxin  56.86 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1039  addiction module antitoxin  42.68 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.584776  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1376  addiction module antitoxin  38.82 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3300  addiction module antitoxin  40 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.991321  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3569  addiction module toxin, RelE/StbE  43.33 
 
 		 90 aa  60.1  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1021  RelE protein  37.65 
 
 		 83 aa  60.1  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1617  addiction module antitoxin  43.33 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000591233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3231  hypothetical protein  36.36 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.73498  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1483  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.96 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0031992  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1966  addiction module toxin, RelE/StbE  31.03 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0245113  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24250  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.08 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1338  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.47 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4390  addiction module antitoxin  31.46 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2645  plasmid stabilization system  42.68 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0214244 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0735  hypothetical protein  36.14 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118152  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3688  addiction module antitoxin  32.93 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125211  normal  0.144102 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1625  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.08 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00126224  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1978  hypothetical protein  34.94 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0782  plasmid stabilization system  32.56 
 
 		 85 aa  51.6  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00543713  normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1442  hypothetical protein  47.17 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0362351 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0473  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.12 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000210818  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2458  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.65 
 
 		 84 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000245877  unclonable  0.000000000270671 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3196  plasmid stabilization system protein  37.78 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3416  addiction module antitoxin  32.56 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866915  normal  0.0981554 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0812  plasmid stabilization system protein  31.76 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00582411  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3785  stability protein StbE  32.93 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3376  addiction module antitoxin  31.03 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1292  toxin-like protein  41.38 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0319  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.49 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0691287  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0794  hypothetical protein  31.71 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.385271  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3073  plasmid stabilization system protein  34.15 
 
 		 83 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.2431  normal  0.0660854 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4716  addiction module toxin RelE  31.82 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1635  addiction module antitoxin  34.57 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.537799  hitchhiker  0.001685 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0985  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.88 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0751  plasmid stabilization system protein  29.03 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0158403  normal  0.887347 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  35.56 
 
 		 712 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1956  plasmid stabilization system protein  22.67 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000296244  n/a   
 
 
 
NC_009425  Ent638_4314  addiction module antitoxin  29.55 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100162  hitchhiker  0.0025912 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1261  addiction module antitoxin  40.23 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1873  addiction module toxin, RelE/StbE  30 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.331501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2032  plasmid addiction system poison protein  30 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0102565  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0193  toxin-antitoxin system, toxin component, RelE family  28.41 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0708  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.09 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2258  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.71 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000447442  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5382  addiction module antitoxin  32.93 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.584673 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1940  plasmid stabilization system  44.23 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1955  hypothetical protein  22.09 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000490141  n/a   
 
 
 
NC_002978  WD0404  hypothetical protein  29.55 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.111449  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12882  hypothetical protein  37.23 
 
 		 87 aa  42  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4185  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.27 
 
 		 95 aa  41.6  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0600  hypothetical protein  36.92 
 
 		 93 aa  42  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152122  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1817  addiction module antitoxin  26.83 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0467735  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0115  putative stability protein StbE  31.46 
 
 		 93 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000821269  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0664  plasmid stabilization system protein  26.97 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175853  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2779  toxin-like protein  31.03 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000388867  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4836  addiction module antitoxin  31.71 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0380  RelE/StbE family addiction module toxin  34.78 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7793  toxin-like protein  43.64 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1272  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.82 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2680  plasmid stabilization system protein  48.65 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0338325  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2275  addiction module toxin, RelE/StbE family  26.44 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1880  hypothetical protein  37.25 
 
 		 84 aa  40.4  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1787  hypothetical protein  37.5 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>