63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1617 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1617  addiction module antitoxin  100 
 
 
92 aa  186  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000591233  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1292  toxin-like protein  75 
 
 
88 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1261  addiction module antitoxin  73.86 
 
 
88 aa  122  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4390  addiction module antitoxin  54.02 
 
 
88 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1625  addiction module toxin, RelE/StbE family  57.78 
 
 
90 aa  105  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00126224  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3231  hypothetical protein  46.59 
 
 
88 aa  100  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.73498  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3196  plasmid stabilization system protein  51.69 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2094  addiction module toxin, RelE/StbE family  51.14 
 
 
86 aa  99.4  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2779  toxin-like protein  48.86 
 
 
88 aa  98.2  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000388867  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1376  addiction module antitoxin  52.27 
 
 
86 aa  97.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0380  RelE/StbE family addiction module toxin  51.69 
 
 
89 aa  95.5  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1338  addiction module toxin, RelE/StbE family  48.86 
 
 
86 aa  91.7  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3569  addiction module toxin, RelE/StbE  46.67 
 
 
90 aa  88.2  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172224  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24250  addiction module toxin, RelE/StbE family  49.43 
 
 
88 aa  87.8  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278684  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1963  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.57 
 
 
89 aa  82.4  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0193  toxin-antitoxin system, toxin component, RelE family  48.31 
 
 
88 aa  78.2  0.00000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0735  hypothetical protein  46.91 
 
 
85 aa  75.5  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118152  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1978  hypothetical protein  45.68 
 
 
85 aa  75.1  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0326  plasmid stabilization system protein  40 
 
 
90 aa  70.9  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.495753  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1483  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.96 
 
 
86 aa  69.7  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0031992  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2032  plasmid addiction system poison protein  40.24 
 
 
85 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0102565  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1966  addiction module toxin, RelE/StbE  36.36 
 
 
85 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0245113  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1021  RelE protein  38.64 
 
 
83 aa  64.3  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3715  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.33 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0751  plasmid stabilization system protein  32.58 
 
 
92 aa  57.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0158403  normal  0.887347 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2275  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.48 
 
 
93 aa  55.1  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0628  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.2 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1039  addiction module antitoxin  37.21 
 
 
85 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.584776  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0473  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.23 
 
 
84 aa  50.4  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000210818  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0812  plasmid stabilization system protein  36.36 
 
 
84 aa  50.1  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00582411  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1272  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.71 
 
 
86 aa  50.4  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.43 
 
 
92 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0742  hypothetical protein  34.88 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2497  plasmid stabilization system protein  34.83 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0985  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.4 
 
 
85 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2099  addiction module antitoxin  41.11 
 
 
85 aa  48.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1635  addiction module antitoxin  33.73 
 
 
84 aa  47  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.537799  hitchhiker  0.001685 
 
 
-
 
NC_002978  WD0126  hypothetical protein  34.07 
 
 
90 aa  47.4  0.00008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2458  addiction module toxin, RelE/StbE family  35 
 
 
84 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000245877  unclonable  0.000000000270671 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1880  hypothetical protein  32.89 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0782  plasmid stabilization system  30.34 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00543713  normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7793  toxin-like protein  45.1 
 
 
91 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1873  addiction module toxin, RelE/StbE  34.48 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.331501  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1817  addiction module antitoxin  30.49 
 
 
84 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0467735  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0823  plasmid stabilization system  35.23 
 
 
87 aa  45.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.305872  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0847  plasmid stabilization system  33.72 
 
 
91 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2000  hypothetical protein  33.33 
 
 
83 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23181  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2644  plasmid stabilization system  30.23 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1956  plasmid stabilization system protein  28.75 
 
 
70 aa  45.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000296244  n/a   
 
 
 
NC_009565  TBFG_12882  hypothetical protein  30.34 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1940  plasmid stabilization system  38.89 
 
 
91 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2100  plasmid stabilization system  50 
 
 
85 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.60445 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0239  plasmid stabilization system  32.43 
 
 
97 aa  43.5  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0375535  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2680  plasmid stabilization system protein  45.83 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0338325  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1777  cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  30.68 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0664  plasmid stabilization system protein  34.44 
 
 
90 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175853  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0773  plasmid stabilization system  35.96 
 
 
84 aa  41.6  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2838  hypothetical protein  33.33 
 
 
95 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0404  hypothetical protein  27.27 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.111449  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11272  hypothetical protein  30.23 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00225082  hitchhiker  0.00711105 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3300  addiction module antitoxin  34.83 
 
 
87 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.991321  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0779  addiction module antitoxin  42.86 
 
 
70 aa  40.4  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0122  hypothetical protein  35.38 
 
 
91 aa  40.4  0.009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>