45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0239 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0239  plasmid stabilization system  100 
 
 		 97 aa  193  8.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0375535  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2644  plasmid stabilization system  51.58 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11272  hypothetical protein  55.81 
 
 		 97 aa  93.6  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00225082  hitchhiker  0.00711105 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12882  hypothetical protein  48.81 
 
 		 87 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0847  plasmid stabilization system  52.44 
 
 		 91 aa  77.4  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2679  plasmid stabilization system protein  53.66 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0131274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1940  plasmid stabilization system  49.35 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7793  toxin-like protein  49.43 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2333  plasmid stabilization system protein  47.25 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal  0.927258 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3209  hypothetical protein  55.74 
 
 		 63 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.133986 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2680  plasmid stabilization system protein  42.86 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0338325  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3586  hypothetical protein  41.67 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2779  toxin-like protein  33.33 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000388867  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2094  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.76 
 
 		 86 aa  51.2  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1483  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.92 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0031992  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0193  toxin-antitoxin system, toxin component, RelE family  31.76 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1850  plasmid stabilization system protein  35 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0340045 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1376  addiction module antitoxin  30.59 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0404  hypothetical protein  33.8 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.111449  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1966  addiction module toxin, RelE/StbE  30.95 
 
 		 85 aa  47  0.00008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0245113  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0269  hypothetical protein  38.67 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0985  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.48 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0735  hypothetical protein  26.19 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118152  n/a   
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1625  addiction module toxin, RelE/StbE family  26.14 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00126224  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4390  addiction module antitoxin  30.59 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24250  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3196  plasmid stabilization system protein  29.89 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1338  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.41 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1617  addiction module antitoxin  32.43 
 
 		 92 aa  43.5  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000591233  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0126  hypothetical protein  31.51 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1873  addiction module toxin, RelE/StbE  30.59 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.331501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2275  addiction module toxin, RelE/StbE family  26.37 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0600  hypothetical protein  34.78 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152122  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1978  hypothetical protein  25 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1261  addiction module antitoxin  33.72 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1292  toxin-like protein  33.72 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1777  cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  37.5 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1039  addiction module antitoxin  32.56 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.584776  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1021  RelE protein  33.33 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1963  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.76 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3231  hypothetical protein  27.59 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.73498  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0122  hypothetical protein  32.47 
 
 		 91 aa  40.4  0.007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2099  addiction module antitoxin  35.29 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0473  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.14 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000210818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>