41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11272 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11272  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  199  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00225082  hitchhiker  0.00711105 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2644  plasmid stabilization system  55.29 
 
 
96 aa  99.8  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0239  plasmid stabilization system  55.81 
 
 
97 aa  93.6  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0375535  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12882  hypothetical protein  54.12 
 
 
87 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0847  plasmid stabilization system  46.67 
 
 
91 aa  87.8  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1940  plasmid stabilization system  46.67 
 
 
91 aa  84  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7793  toxin-like protein  49.41 
 
 
91 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2333  plasmid stabilization system protein  44.83 
 
 
93 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal  0.927258 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2679  plasmid stabilization system protein  48.28 
 
 
95 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0131274  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2680  plasmid stabilization system protein  44.05 
 
 
98 aa  65.5  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0338325  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1850  plasmid stabilization system protein  34.41 
 
 
92 aa  60.1  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0340045 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3064  hypothetical protein  32.98 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3209  hypothetical protein  44.26 
 
 
63 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.133986 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1966  addiction module toxin, RelE/StbE  33.33 
 
 
85 aa  51.6  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0245113  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1039  addiction module antitoxin  37.65 
 
 
85 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.584776  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0735  hypothetical protein  34.52 
 
 
85 aa  51.6  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118152  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3586  hypothetical protein  35.56 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7921  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1625  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.41 
 
 
90 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00126224  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1978  hypothetical protein  33.73 
 
 
85 aa  48.9  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2094  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.14 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1873  addiction module toxin, RelE/StbE  34.88 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.331501  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0126  hypothetical protein  30.14 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0628  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.9 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0122  hypothetical protein  30.86 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0600  hypothetical protein  31.33 
 
 
93 aa  45.4  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1483  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.33 
 
 
86 aa  45.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0031992  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24250  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.52 
 
 
88 aa  45.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278684  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1376  addiction module antitoxin  30.95 
 
 
86 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.22 
 
 
92 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2275  addiction module toxin, RelE/StbE family  26.09 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2099  addiction module antitoxin  32.94 
 
 
85 aa  42  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2779  toxin-like protein  34.62 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000388867  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1338  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.95 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3569  addiction module toxin, RelE/StbE  26.74 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172224  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0404  hypothetical protein  29.73 
 
 
99 aa  41.6  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.111449  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3196  plasmid stabilization system protein  29.89 
 
 
89 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3231  hypothetical protein  40.38 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.73498  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0269  hypothetical protein  35.14 
 
 
102 aa  40.8  0.006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2497  plasmid stabilization system protein  30.95 
 
 
87 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1617  addiction module antitoxin  30.23 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000591233  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1261  addiction module antitoxin  34.88 
 
 
88 aa  40.8  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>