36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2000 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2000  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  169  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23181  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2268  XRE family transcriptional regulator  63.16 
 
 		 201 aa  103  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4743  plasmid stabilization system  53.57 
 
 		 86 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.786175  normal  0.0196612 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6628  hypothetical protein  45.78 
 
 		 82 aa  82  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.273077 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0985  addiction module toxin, RelE/StbE family  44.05 
 
 		 85 aa  67  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1021  RelE protein  44.58 
 
 		 83 aa  62  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4070  plasmid stabilization system protein  40.96 
 
 		 80 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2944  hypothetical protein  44.78 
 
 		 68 aa  62  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110723 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3171  hypothetical protein  44.78 
 
 		 68 aa  62  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00924455  normal  0.507561 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1787  hypothetical protein  43.48 
 
 		 69 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1680  hypothetical protein  41.98 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.521078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0603  plasmid stabilization system  36.14 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.837316  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1817  addiction module antitoxin  30.49 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0467735  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3073  plasmid stabilization system protein  32.53 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.2431  normal  0.0660854 
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.71 
 
 		 92 aa  50.4  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3300  addiction module antitoxin  34.15 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.991321  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2275  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.9 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4390  addiction module antitoxin  38.82 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1617  addiction module antitoxin  33.33 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000591233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0823  plasmid stabilization system  30.86 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.305872  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0433  hypothetical protein  31.03 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.615805  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0406  plasmid stabilization system  34.52 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.241329  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0473  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.94 
 
 		 84 aa  43.5  0.0009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000210818  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2414  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.496322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1376  addiction module antitoxin  34.52 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24250  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.05 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0751  plasmid stabilization system protein  30.23 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0158403  normal  0.887347 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1017  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000594765  unclonable  0.00000000272717 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0812  plasmid stabilization system protein  34.15 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00582411  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2094  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.9 
 
 		 86 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0782  plasmid stabilization system  30.49 
 
 		 85 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00543713  normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1292  toxin-like protein  32.53 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  36.84 
 
 		 712 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0664  plasmid stabilization system protein  34.21 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175853  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0742  hypothetical protein  28.4 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1625  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.76 
 
 		 90 aa  40  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00126224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>