23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4743 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4743  plasmid stabilization system  100 
 
 		 86 aa  173  8e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.786175  normal  0.0196612 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2000  hypothetical protein  53.57 
 
 		 83 aa  99.4  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23181  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2268  XRE family transcriptional regulator  53.95 
 
 		 201 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6628  hypothetical protein  48.81 
 
 		 82 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.273077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3171  hypothetical protein  49.25 
 
 		 68 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00924455  normal  0.507561 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2944  hypothetical protein  49.25 
 
 		 68 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110723 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0985  addiction module toxin, RelE/StbE family  40 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3073  plasmid stabilization system protein  39.02 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.2431  normal  0.0660854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4070  plasmid stabilization system protein  42.86 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0603  plasmid stabilization system  38.1 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.837316  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1787  hypothetical protein  42.86 
 
 		 69 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0473  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.15 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000210818  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1817  addiction module antitoxin  28.92 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0467735  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1017  plasmid stabilization system protein  33.73 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000594765  unclonable  0.00000000272717 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2275  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.12 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0812  plasmid stabilization system protein  32.93 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00582411  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3192  plasmid stabilization system  30.12 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.82 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0433  hypothetical protein  37.21 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.615805  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1680  hypothetical protein  38.75 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.521078 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2497  plasmid stabilization system protein  32.89 
 
 		 87 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2259  UvrD/REP helicase  32.84 
 
 		 710 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0960519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  32.84 
 
 		 697 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>