32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1442 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1442  hypothetical protein  100 
 
 		 59 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0362351 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0773  plasmid stabilization system  59.26 
 
 		 84 aa  61.2  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3300  addiction module antitoxin  46.43 
 
 		 87 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.991321  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1039  addiction module antitoxin  38.98 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.584776  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0823  plasmid stabilization system  41.07 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.305872  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2100  plasmid stabilization system  42.11 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.60445 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0628  addiction module toxin, RelE/StbE family  52.08 
 
 		 85 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1376  addiction module antitoxin  47.27 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2094  addiction module toxin, RelE/StbE family  47.27 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3715  addiction module toxin, RelE/StbE family  47.17 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2497  plasmid stabilization system protein  38.6 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2099  addiction module antitoxin  42.59 
 
 		 85 aa  50.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.98 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1338  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.64 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2645  plasmid stabilization system  49.09 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0214244 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0471  addiction module toxin, RelE/StbE family  46 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000228475  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0779  addiction module antitoxin  41.51 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0735  hypothetical protein  37.04 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118152  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1978  hypothetical protein  38.89 
 
 		 85 aa  47.8  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3231  hypothetical protein  41.07 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.73498  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0600  hypothetical protein  41.82 
 
 		 93 aa  47  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152122  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3416  addiction module antitoxin  46.51 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866915  normal  0.0981554 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24250  addiction module toxin, RelE/StbE family  46 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0782  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 85 aa  43.9  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00543713  normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0985  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.09 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1966  addiction module toxin, RelE/StbE  32.65 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0245113  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3992  plasmid stabilization system  37.74 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0288858  normal  0.818838 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1635  addiction module antitoxin  42.55 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.537799  hitchhiker  0.001685 
 
 
-
 
NC_002978  WD0122  hypothetical protein  40 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1292  toxin-like protein  45.1 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4390  addiction module antitoxin  34 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0433  hypothetical protein  36.17 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.615805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>