66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_B0018 on replicon NC_011092
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2079  addiction module toxin, RelE/StbE family  100 
 
 
95 aa  188  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00218718  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0018  toxin RelE  100 
 
 
95 aa  188  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2072  addiction module antitoxin  100 
 
 
95 aa  188  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2227  addiction module antitoxin  72.34 
 
 
94 aa  149  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0239944  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4647  addiction module antitoxin  69.15 
 
 
94 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4469  addiction module toxin, RelE/StbE family  69.15 
 
 
94 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505994  normal  0.573834 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4332  addiction module toxin, RelE/StbE family  69.15 
 
 
94 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4397  addiction module antitoxin  69.15 
 
 
94 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal  0.935834 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5387  stability cassette protein, putative  71.28 
 
 
96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0708  addiction module toxin, RelE/StbE family  63.83 
 
 
94 aa  128  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0115  putative stability protein StbE  70 
 
 
93 aa  126  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000821269  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0435  addiction module antitoxin  65.96 
 
 
94 aa  125  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4716  addiction module toxin RelE  63.83 
 
 
96 aa  122  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4830  putative stability protein StbE  67.02 
 
 
94 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2439  RelE protein  60.64 
 
 
96 aa  120  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193835  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1469  putative plasmid stabilisation system protein  59.57 
 
 
94 aa  116  9e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.165331  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4701  putative stability protein StbE  67.02 
 
 
94 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.86483 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3849  addiction module antitoxin  57.45 
 
 
103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000246767 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4796  putative stability protein StbE  65.96 
 
 
94 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4546  addiction module antitoxin  60.22 
 
 
95 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.747035  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4851  putative stability protein StbE  65.96 
 
 
94 aa  113  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4314  addiction module antitoxin  54.26 
 
 
95 aa  111  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100162  hitchhiker  0.0025912 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4185  addiction module toxin, RelE/StbE family  56.38 
 
 
95 aa  110  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0823  hypothetical protein  56.38 
 
 
96 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.382841  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2258  addiction module toxin, RelE/StbE family  57.45 
 
 
95 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000447442  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5382  addiction module antitoxin  58.06 
 
 
93 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.584673 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1619  putative stability protein StbE  62.07 
 
 
94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.476443  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1655  putative stability protein StbE  62.07 
 
 
94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0319  addiction module toxin, RelE/StbE family  59.14 
 
 
95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0691287  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1721  putative stability protein StbE  60.92 
 
 
94 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165239  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4836  addiction module antitoxin  56.99 
 
 
93 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3688  addiction module antitoxin  57.89 
 
 
95 aa  103  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125211  normal  0.144102 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3785  stability protein StbE  53.68 
 
 
96 aa  101  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44980  Cytotoxin, RelE protein  62.37 
 
 
93 aa  101  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3833  plasmid stabilization system protein  59.57 
 
 
96 aa  100  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0794  hypothetical protein  51.06 
 
 
96 aa  99  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.385271  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1012  addiction module toxin, RelE/StbE family  53.76 
 
 
93 aa  98.2  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.247568  hitchhiker  0.000000000573461 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0890  stability protein StbE, putative  53.76 
 
 
93 aa  98.2  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1073  addiction module toxin, RelE/StbE family  47.31 
 
 
114 aa  96.7  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.588523  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1758  addiction module toxin, RelE/StbE family  47.31 
 
 
114 aa  96.3  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.532041  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0089  hypothetical protein  51.06 
 
 
95 aa  94.7  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.735538  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4264  hypothetical protein  97.96 
 
 
49 aa  94.4  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4228  hypothetical protein  95.92 
 
 
49 aa  92.8  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0155  plasmid stabilization system protein  60.53 
 
 
77 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.123434 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00613  putative relE protein  58.51 
 
 
97 aa  90.5  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.164171  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1208  plasmid stabilization system protein  62.32 
 
 
81 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3376  addiction module antitoxin  54.88 
 
 
88 aa  88.6  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5358  plasmid stabilization system protein  58.33 
 
 
72 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5502  plasmid stabilization system protein  58.33 
 
 
72 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.518192  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2746  addiction module toxin, RelE/StbE family  50 
 
 
106 aa  81.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1588  hypothetical protein  56.16 
 
 
85 aa  81.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4263  hypothetical protein  97.14 
 
 
35 aa  70.1  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4227  hypothetical protein  97.14 
 
 
35 aa  70.1  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0244  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.55 
 
 
109 aa  68.2  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1119  addiction module toxin, RelE/StbE  51.61 
 
 
95 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.197659  normal  0.189109 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1997  addiction module antitoxin  77.78 
 
 
37 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.67699  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1266  hypothetical protein  50.54 
 
 
95 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0704408  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4769  plasmid stabilization system protein  60 
 
 
50 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3603  prevent-host-death family protein  36.9 
 
 
176 aa  61.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0840  putative inner membrane protein  52.83 
 
 
61 aa  55.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0782  plasmid stabilization system  40.26 
 
 
98 aa  51.6  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2497  plasmid stabilization system protein  31.71 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.812855 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03534  hypothetical protein  58.82 
 
 
48 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3073  plasmid stabilization system protein  29.33 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.2431  normal  0.0660854 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0380  RelE/StbE family addiction module toxin  33.72 
 
 
89 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3196  plasmid stabilization system protein  32.22 
 
 
89 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>