158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0764 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0764  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  100 
 
 
92 aa  183  8e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0268  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  66.67 
 
 
78 aa  96.7  9e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.123557  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2140  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  58.11 
 
 
83 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.930293  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0384  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  57.69 
 
 
82 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.011822  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0268  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  54.55 
 
 
83 aa  86.7  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12267 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1243  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  60 
 
 
83 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.800937  normal  0.165339 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2950  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  56.94 
 
 
80 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.556547 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3924  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  54.41 
 
 
88 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.377852  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1433  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  46.48 
 
 
71 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1215  hydrogenase maturation factor  45.07 
 
 
71 aa  60.5  0.000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0118  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  44.87 
 
 
76 aa  60.5  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00072564  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1951  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.79 
 
 
76 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3131  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  46.48 
 
 
76 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3064  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.47 
 
 
76 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163883  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1429  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  42.17 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.149613  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1131  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  47.14 
 
 
76 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1241  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.66 
 
 
71 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50460  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  50.68 
 
 
84 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0945297  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4093  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.23 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.227783  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0177  hydrogenase expression/formation protein  42.86 
 
 
79 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0307  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  59.52 
 
 
76 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2887  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  45.45 
 
 
81 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.348602 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3289  hydrogenase assembly chaperone HypC  45.45 
 
 
81 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1961  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  44.16 
 
 
85 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3879  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.86 
 
 
91 aa  53.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1168  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.67 
 
 
77 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.996311  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0536  hydrogenase expression/formation protein, HupF/HypC  37.5 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2779  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.71 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3445  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  35.14 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.526541  normal  0.465123 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3681  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2536  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.51 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2162  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  34.72 
 
 
81 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0932  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  38.04 
 
 
92 aa  51.6  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.305278  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0872  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  43.42 
 
 
97 aa  51.2  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.644778  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0307  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  47.83 
 
 
76 aa  50.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214881  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1815  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.11 
 
 
81 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1095  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  41.25 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.44829  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1097  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.33 
 
 
89 aa  50.8  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1381  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  33.8 
 
 
76 aa  50.4  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00885593  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2490  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  34.21 
 
 
87 aa  50.4  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.228537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1870  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  34.72 
 
 
81 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0470  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.02 
 
 
85 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.503239  normal  0.167546 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2026  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.11 
 
 
82 aa  50.1  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2742  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.99 
 
 
82 aa  50.4  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3752  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  32.94 
 
 
93 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2092  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  34.12 
 
 
81 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0531  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  44.87 
 
 
95 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0138  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.86 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0491338  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3760  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.84 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0326  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.84 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00530973  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2538  hydrogenase expression/formation protein HypC  41.67 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2393  hydrogenase expression/formation protein HypC  41.67 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2016  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.03 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1758  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  35.06 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0931  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  29.89 
 
 
90 aa  48.9  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1090  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.64 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1914  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  32.94 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.384554  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2447  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.67 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0458574 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1672  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  32.88 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.968118 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1882  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  32.94 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0641  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.51 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.858421  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1907  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  32.94 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0933507  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3967  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  40 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2050  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.79 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0723  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  35.56 
 
 
91 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0558163  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1071  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.54 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61575  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0790  hydrogenase assembly chaperone HypC  40 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.475375  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1763  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.1 
 
 
75 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2042  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  35.06 
 
 
79 aa  47.8  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0206  hypothetical protein  31.94 
 
 
115 aa  47.8  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.00000000527651  normal  0.0573438 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1835  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  34.72 
 
 
81 aa  47.8  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0575  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.25 
 
 
88 aa  47.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.306359  normal  0.178324 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01190  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  37.33 
 
 
83 aa  47.4  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2813  putative hypC  41.67 
 
 
81 aa  47  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4603  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  33.72 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0141  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  33.71 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2008  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  35.62 
 
 
86 aa  47  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2110  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  34.72 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.305152  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0263  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2257  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.19 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0050  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.04 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1343  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0398  hypothetical protein  30.56 
 
 
115 aa  47  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.110353  normal  0.968309 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1784  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.16 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.019242  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4098  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  52.27 
 
 
72 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3208  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  34.04 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2308  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.19 
 
 
83 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.685831 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1642  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.36 
 
 
86 aa  45.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1288  hypothetical protein  33.78 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.758563  normal  0.840591 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3235  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  33.73 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3635  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.49 
 
 
73 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2412  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  31.76 
 
 
81 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0703435  hitchhiker  0.0000250564 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0388  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.57 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.984781  hitchhiker  0.00000000422403 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1456  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  42.5 
 
 
90 aa  45.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0478  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  32.88 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213434  normal  0.190427 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1283  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  38.89 
 
 
75 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.409533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1946  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.49 
 
 
100 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1176  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  52.63 
 
 
70 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10029  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3980  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  33.33 
 
 
105 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.943187  normal  0.61085 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3797  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  30.68 
 
 
89 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.777616 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>