33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1288 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1288  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  223  9e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.758563  normal  0.840591 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0398  hypothetical protein  81.74 
 
 		 115 aa  188  2e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.110353  normal  0.968309 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0206  hypothetical protein  86.96 
 
 		 115 aa  179  1e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.00000000527651  normal  0.0573438 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1565  hypothetical protein  49.02 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1614  hypothetical protein  39.42 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0101786  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0931  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  33.33 
 
 		 90 aa  50.8  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2950  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.8 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.556547 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0683  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.43 
 
 		 74 aa  47.4  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0764  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  33.78 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1131  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.23 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1429  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  34.25 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.149613  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3131  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.23 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0918  hypothetical protein  31.94 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2110  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  29.73 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.305152  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1215  hydrogenase maturation factor  31.43 
 
 		 71 aa  44.3  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2042  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  31.17 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2490  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  29.63 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228537 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2779  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  35.9 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1095  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  29.87 
 
 		 79 aa  42.7  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.44829  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1433  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  31.43 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1241  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  31.43 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1815  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  29.63 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2162  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  28.4 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0932  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  29.33 
 
 		 92 aa  42  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.305278  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1901  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  29.49 
 
 		 79 aa  41.2  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000307704 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1600  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  32.39 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1892  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  29.33 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1951  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  34.78 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0790  hydrogenase assembly chaperone HypC  25.68 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.475375  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0268  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  34.25 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.123557  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0727  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  25 
 
 		 93 aa  40  0.01  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.267852  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1835  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  28 
 
 		 81 aa  40  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0653  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  25 
 
 		 93 aa  40  0.01  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>