42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0398 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0398  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  223  6e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.110353  normal  0.968309 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0206  hypothetical protein  90.43 
 
 		 115 aa  192  1e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.00000000527651  normal  0.0573438 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1288  hypothetical protein  81.74 
 
 		 115 aa  188  2e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.758563  normal  0.840591 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1565  hypothetical protein  45.1 
 
 		 115 aa  94  6e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1614  hypothetical protein  40.95 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0101786  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0931  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  33.33 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2950  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.59 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.556547 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1131  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.13 
 
 		 76 aa  50.1  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3131  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.13 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0683  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.86 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2042  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  33.77 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0918  hypothetical protein  35.62 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0764  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  30.56 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2110  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  29.73 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.305152  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2779  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.71 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1951  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.68 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0268  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  34.25 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.123557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1241  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  32.86 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1672  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  31.65 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.968118 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1215  hydrogenase maturation factor  31.43 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1095  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  31.17 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.44829  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1815  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  29.63 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2162  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  28.4 
 
 		 81 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1835  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  29.33 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1433  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  31.43 
 
 		 71 aa  42.7  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1429  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  31.51 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.149613  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1882  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  30.26 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2008  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  29.21 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0790  hydrogenase assembly chaperone HypC  27.03 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.475375  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0932  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  29.33 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.305278  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1914  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  30.26 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.384554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1901  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  29.49 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000307704 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1907  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  30.26 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0933507  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1870  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  27.16 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0641  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  31.71 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.858421  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2412  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  30.26 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0703435  hitchhiker  0.0000250564 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0141  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.2 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0307  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0050  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  32.86 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0366  hypothetical protein  35.62 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0872  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  27.27 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.644778  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1739  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  26.92 
 
 		 75 aa  40  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>