58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0360 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0360  hypothetical protein  100 
 
 
391 aa  807    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0333  Glycosyltransferase 28 domain protein  67.52 
 
 
414 aa  568  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0739  hypothetical protein  53.37 
 
 
391 aa  424  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3905  glycosyltransferase family 28 protein  51.16 
 
 
401 aa  378  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0957738 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3688  hypothetical protein  36.96 
 
 
406 aa  245  8e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.112899 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4596  putative membrane-anchored protein  38.54 
 
 
404 aa  243  6e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.576563  normal  0.938247 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7127  membrane-anchored protein  37.22 
 
 
402 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5974  membrane-anchored protein  36.94 
 
 
401 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.951983  normal  0.842489 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6470  RedA-like protein  38.04 
 
 
394 aa  230  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7222  RedA-like protein  38.59 
 
 
398 aa  230  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0204  response regulator receiver protein  35.55 
 
 
474 aa  227  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3927  hypothetical protein  37.53 
 
 
402 aa  225  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0614  hypothetical protein  36.71 
 
 
409 aa  224  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2825  hypothetical protein  39.2 
 
 
416 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.791946  normal  0.436894 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0765  glycosyl transferase-like protein  37.26 
 
 
472 aa  224  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.51798  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2432  hypothetical protein  35.23 
 
 
423 aa  219  8.999999999999998e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.18236 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4270  hypothetical protein  33.62 
 
 
427 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4330  hypothetical protein  32.56 
 
 
427 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0675545 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1994  putative glycosyltransferase  33.61 
 
 
386 aa  193  6e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0252697  normal  0.74194 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2799  hypothetical protein  33.76 
 
 
410 aa  172  6.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.516994  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01990  predicted glycosyl transferase  27.59 
 
 
461 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0254  hypothetical protein  26.67 
 
 
374 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.965107  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0735  hypothetical protein  24.66 
 
 
401 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3925  hypothetical protein  22.89 
 
 
366 aa  79.7  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0356  hypothetical protein  24.66 
 
 
386 aa  79  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5976  Glycosyltransferase 28 domain  22.01 
 
 
382 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211682  normal  0.611684 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4598  glycosyltransferase family 28 protein  22.1 
 
 
384 aa  69.3  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312674  normal  0.707093 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2827  glycosyl transferase-like protein  23.68 
 
 
650 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7129  Glycosyltransferase 28 domain protein  21.04 
 
 
381 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.379317 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1304  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  22.29 
 
 
367 aa  53.1  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3692  hypothetical protein  20.64 
 
 
379 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.833754 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2994  monogalactosyldiacylglycerol synthase  26.73 
 
 
431 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000104311  hitchhiker  0.00600632 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6473  glycosyltransferase family 28 protein  23.95 
 
 
671 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0174404  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0202  hypothetical protein  23.66 
 
 
382 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.45206 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2423  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  25.97 
 
 
369 aa  48.5  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.282018  normal  0.817725 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0145  hypothetical protein  23.66 
 
 
382 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.472245 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1262  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  30.68 
 
 
353 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110546  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0213  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  21.43 
 
 
355 aa  45.1  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3963  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  22.63 
 
 
364 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0175546  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3868  glycosyltransferase family 28 protein  24.68 
 
 
527 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.479264  normal  0.241184 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1493  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  28.74 
 
 
336 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0427088  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3956  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  22.63 
 
 
364 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119069  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0476  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  25.68 
 
 
358 aa  44.7  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3737  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  20.62 
 
 
364 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0884581  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1146  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  24.5 
 
 
373 aa  44.3  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0122052  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7225  Glycosyltransferase 28 domain protein  23.94 
 
 
671 aa  43.9  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498881  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2560  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  20 
 
 
364 aa  43.5  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0738206  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3487  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  26.35 
 
 
371 aa  43.1  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2095  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N- acetylglucosamine transferase  26.67 
 
 
367 aa  43.1  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.310142  hitchhiker  0.00000372549 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0286  hypothetical protein  22.81 
 
 
380 aa  43.1  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3925  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  24.56 
 
 
383 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000449575 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3364  Monogalactosyldiacylglycerol synthase  27.06 
 
 
379 aa  43.1  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.804764  hitchhiker  0.000516086 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4011  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  21.9 
 
 
389 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000569587  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4049  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  21.9 
 
 
364 aa  43.1  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312933  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3669  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  21.9 
 
 
364 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3652  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  21.9 
 
 
364 aa  43.1  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.790343  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3761  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  21.9 
 
 
364 aa  43.1  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3727  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  27.38 
 
 
355 aa  42.7  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>