37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5974 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5974  membrane-anchored protein  100 
 
 
401 aa  821    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.951983  normal  0.842489 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7127  membrane-anchored protein  94.75 
 
 
402 aa  752    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4596  putative membrane-anchored protein  73 
 
 
404 aa  598  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.576563  normal  0.938247 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3927  hypothetical protein  70.25 
 
 
402 aa  548  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6470  RedA-like protein  48.01 
 
 
394 aa  340  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7222  RedA-like protein  47.75 
 
 
398 aa  334  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3688  hypothetical protein  44.39 
 
 
406 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.112899 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2825  hypothetical protein  41.49 
 
 
416 aa  294  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.791946  normal  0.436894 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3905  glycosyltransferase family 28 protein  43.59 
 
 
401 aa  270  4e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0957738 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4270  hypothetical protein  37.24 
 
 
427 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0360  hypothetical protein  38.89 
 
 
391 aa  258  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4330  hypothetical protein  37.24 
 
 
427 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0675545 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0333  Glycosyltransferase 28 domain protein  36.57 
 
 
414 aa  247  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0739  hypothetical protein  37.57 
 
 
391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2432  hypothetical protein  37.79 
 
 
423 aa  227  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.18236 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1994  putative glycosyltransferase  35.67 
 
 
386 aa  211  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0252697  normal  0.74194 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0614  hypothetical protein  32.99 
 
 
409 aa  181  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0765  glycosyl transferase-like protein  31.89 
 
 
472 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.51798  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01990  predicted glycosyl transferase  30.88 
 
 
461 aa  171  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2799  hypothetical protein  32.73 
 
 
410 aa  168  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.516994  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0204  response regulator receiver protein  28.81 
 
 
474 aa  160  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0254  hypothetical protein  25.29 
 
 
374 aa  89.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.965107  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5976  Glycosyltransferase 28 domain  24.18 
 
 
382 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211682  normal  0.611684 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7129  Glycosyltransferase 28 domain protein  22.59 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.379317 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3925  hypothetical protein  22.37 
 
 
366 aa  73.6  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4598  glycosyltransferase family 28 protein  22.33 
 
 
384 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312674  normal  0.707093 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0735  hypothetical protein  23.08 
 
 
401 aa  69.7  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0356  hypothetical protein  22.62 
 
 
386 aa  69.3  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2358  putative glycosyltransferase protein  25.9 
 
 
396 aa  61.6  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0125042  normal  0.920267 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2827  glycosyl transferase-like protein  24.38 
 
 
650 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3692  hypothetical protein  24.19 
 
 
379 aa  57.8  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.833754 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6473  glycosyltransferase family 28 protein  25 
 
 
671 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0174404  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0507  glycosyltransferase family 28 protein  27.06 
 
 
361 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1401  glycosyltransferase family 28 protein  26.39 
 
 
361 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1235  glycosyltransferase family 28 protein  26.39 
 
 
361 aa  46.6  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110659  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7225  Glycosyltransferase 28 domain protein  26.4 
 
 
671 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498881  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0478  glycosyltransferase family 28 protein  27.36 
 
 
433 aa  43.5  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>