36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7127 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_7127  membrane-anchored protein  100 
 
 		 402 aa  822    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5974  membrane-anchored protein  94.75 
 
 		 401 aa  754    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.951983  normal  0.842489 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4596  putative membrane-anchored protein  73.25 
 
 		 404 aa  595  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.576563  normal  0.938247 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3927  hypothetical protein  71.32 
 
 		 402 aa  550  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6470  RedA-like protein  47.09 
 
 		 394 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7222  RedA-like protein  46.95 
 
 		 398 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3688  hypothetical protein  44.91 
 
 		 406 aa  313  4.999999999999999e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.112899 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2825  hypothetical protein  41.24 
 
 		 416 aa  295  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.791946  normal  0.436894 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3905  glycosyltransferase family 28 protein  40.15 
 
 		 401 aa  267  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0957738 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0360  hypothetical protein  38.89 
 
 		 391 aa  258  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4270  hypothetical protein  36.99 
 
 		 427 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4330  hypothetical protein  36.99 
 
 		 427 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0675545 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0739  hypothetical protein  38.36 
 
 		 391 aa  248  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0333  Glycosyltransferase 28 domain protein  36.29 
 
 		 414 aa  244  3e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2432  hypothetical protein  37.6 
 
 		 423 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.18236 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1994  putative glycosyltransferase  34.04 
 
 		 386 aa  215  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0252697  normal  0.74194 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0614  hypothetical protein  32.21 
 
 		 409 aa  180  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0765  glycosyl transferase-like protein  30.91 
 
 		 472 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.51798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2799  hypothetical protein  32.73 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.516994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01990  predicted glycosyl transferase  29.9 
 
 		 461 aa  167  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0204  response regulator receiver protein  29.97 
 
 		 474 aa  161  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0254  hypothetical protein  25.29 
 
 		 374 aa  90.5  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.965107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0735  hypothetical protein  23.89 
 
 		 401 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5976  Glycosyltransferase 28 domain  23.89 
 
 		 382 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211682  normal  0.611684 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4598  glycosyltransferase family 28 protein  24.32 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312674  normal  0.707093 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0356  hypothetical protein  24.63 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7129  Glycosyltransferase 28 domain protein  22.95 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.379317 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3925  hypothetical protein  22.89 
 
 		 366 aa  72.8  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3692  hypothetical protein  24.79 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.833754 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2827  glycosyl transferase-like protein  23.14 
 
 		 650 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2358  putative glycosyltransferase protein  24.74 
 
 		 396 aa  53.9  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0125042  normal  0.920267 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6473  glycosyltransferase family 28 protein  26.39 
 
 		 671 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0174404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0507  glycosyltransferase family 28 protein  27.66 
 
 		 361 aa  47  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1401  glycosyltransferase family 28 protein  26.98 
 
 		 361 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1235  glycosyltransferase family 28 protein  27.13 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110659  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7225  Glycosyltransferase 28 domain protein  26.97 
 
 		 671 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>