38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3927 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3927  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  822    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4596  putative membrane-anchored protein  70.07 
 
 		 404 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.576563  normal  0.938247 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7127  membrane-anchored protein  71.32 
 
 		 402 aa  549  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5974  membrane-anchored protein  70.25 
 
 		 401 aa  548  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.951983  normal  0.842489 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6470  RedA-like protein  47.35 
 
 		 394 aa  335  9e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7222  RedA-like protein  47.09 
 
 		 398 aa  324  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3688  hypothetical protein  43.04 
 
 		 406 aa  306  3e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.112899 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2825  hypothetical protein  41.34 
 
 		 416 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.791946  normal  0.436894 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0333  Glycosyltransferase 28 domain protein  38.78 
 
 		 414 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0360  hypothetical protein  37.53 
 
 		 391 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4270  hypothetical protein  36.9 
 
 		 427 aa  249  8e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4330  hypothetical protein  36.39 
 
 		 427 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0675545 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0739  hypothetical protein  37.53 
 
 		 391 aa  247  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3905  glycosyltransferase family 28 protein  41.41 
 
 		 401 aa  247  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0957738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2432  hypothetical protein  36.39 
 
 		 423 aa  228  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.18236 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1994  putative glycosyltransferase  33.51 
 
 		 386 aa  211  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0252697  normal  0.74194 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0765  glycosyl transferase-like protein  30.85 
 
 		 472 aa  190  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.51798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0614  hypothetical protein  30.85 
 
 		 409 aa  190  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2799  hypothetical protein  36.11 
 
 		 410 aa  177  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.516994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0204  response regulator receiver protein  29.14 
 
 		 474 aa  162  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01990  predicted glycosyl transferase  28.7 
 
 		 461 aa  158  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0254  hypothetical protein  25.59 
 
 		 374 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.965107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4598  glycosyltransferase family 28 protein  25.73 
 
 		 384 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312674  normal  0.707093 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7129  Glycosyltransferase 28 domain protein  25.14 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.379317 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5976  Glycosyltransferase 28 domain  25.81 
 
 		 382 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211682  normal  0.611684 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3925  hypothetical protein  24.93 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0735  hypothetical protein  22.57 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0356  hypothetical protein  22.62 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2827  glycosyl transferase-like protein  26.97 
 
 		 650 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3692  hypothetical protein  24.63 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.833754 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2358  putative glycosyltransferase protein  26.33 
 
 		 396 aa  55.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0125042  normal  0.920267 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1910  glycosyl transferase family 2  23.06 
 
 		 622 aa  51.2  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00799183  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0478  glycosyltransferase family 28 protein  27.15 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6473  glycosyltransferase family 28 protein  25.84 
 
 		 671 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0174404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2994  monogalactosyldiacylglycerol synthase  30.14 
 
 		 431 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000104311  hitchhiker  0.00600632 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1522  hypothetical protein  25.71 
 
 		 337 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00720586  normal  0.955274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2020  monogalactosyldiacylglycerol synthase  30.47 
 
 		 432 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3326  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  22.43 
 
 		 371 aa  43.5  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.17212  normal  0.898301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>