41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3905 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3905  glycosyltransferase family 28 protein  100 
 
 		 401 aa  825    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0957738 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0360  hypothetical protein  51.16 
 
 		 391 aa  396  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0333  Glycosyltransferase 28 domain protein  47.3 
 
 		 414 aa  378  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0739  hypothetical protein  45.78 
 
 		 391 aa  338  8e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4596  putative membrane-anchored protein  43.3 
 
 		 404 aa  263  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.576563  normal  0.938247 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5974  membrane-anchored protein  43.59 
 
 		 401 aa  258  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.951983  normal  0.842489 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7127  membrane-anchored protein  40.26 
 
 		 402 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3927  hypothetical protein  41.6 
 
 		 402 aa  236  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6470  RedA-like protein  38.9 
 
 		 394 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3688  hypothetical protein  36.02 
 
 		 406 aa  226  7e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.112899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2432  hypothetical protein  36.9 
 
 		 423 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.18236 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4270  hypothetical protein  34.86 
 
 		 427 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4330  hypothetical protein  34.61 
 
 		 427 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0675545 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7222  RedA-like protein  37.26 
 
 		 398 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0765  glycosyl transferase-like protein  32.22 
 
 		 472 aa  201  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.51798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0614  hypothetical protein  32.22 
 
 		 409 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2825  hypothetical protein  35.33 
 
 		 416 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.791946  normal  0.436894 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1994  putative glycosyltransferase  33.98 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0252697  normal  0.74194 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0204  response regulator receiver protein  34 
 
 		 474 aa  187  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2799  hypothetical protein  31.74 
 
 		 410 aa  151  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.516994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01990  predicted glycosyl transferase  28.16 
 
 		 461 aa  150  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3925  hypothetical protein  24.54 
 
 		 366 aa  101  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0254  hypothetical protein  26.94 
 
 		 374 aa  98.2  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.965107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0735  hypothetical protein  25.6 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0356  hypothetical protein  23.48 
 
 		 386 aa  69.7  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5976  Glycosyltransferase 28 domain  21.14 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211682  normal  0.611684 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7129  Glycosyltransferase 28 domain protein  21.98 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.379317 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4598  glycosyltransferase family 28 protein  24.46 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312674  normal  0.707093 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3692  hypothetical protein  26.23 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.833754 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0286  hypothetical protein  22.95 
 
 		 380 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0145  hypothetical protein  22.66 
 
 		 382 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.472245 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0199  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  27.42 
 
 		 357 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3868  glycosyltransferase family 28 protein  23.46 
 
 		 527 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.479264  normal  0.241184 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0202  hypothetical protein  22.1 
 
 		 382 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.45206 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3506  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  26.8 
 
 		 360 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2994  monogalactosyldiacylglycerol synthase  26.14 
 
 		 431 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000104311  hitchhiker  0.00600632 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1571  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  26.19 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.85912 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1080  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  27.27 
 
 		 357 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0476  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  36.14 
 
 		 358 aa  44.3  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6473  glycosyltransferase family 28 protein  35.14 
 
 		 671 aa  43.5  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0174404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0774  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  32.14 
 
 		 356 aa  43.1  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>