30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_01990 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_01990  predicted glycosyl transferase  100 
 
 		 461 aa  884    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4270  hypothetical protein  30.48 
 
 		 427 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4330  hypothetical protein  30.48 
 
 		 427 aa  209  7e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0675545 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2432  hypothetical protein  30.87 
 
 		 423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.18236 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1994  putative glycosyltransferase  33.63 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0252697  normal  0.74194 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0333  Glycosyltransferase 28 domain protein  29.64 
 
 		 414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6470  RedA-like protein  34.45 
 
 		 394 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3688  hypothetical protein  33.99 
 
 		 406 aa  170  6e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.112899 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4596  putative membrane-anchored protein  30.02 
 
 		 404 aa  159  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.576563  normal  0.938247 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2799  hypothetical protein  37.28 
 
 		 410 aa  158  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.516994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5974  membrane-anchored protein  30.12 
 
 		 401 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.951983  normal  0.842489 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0739  hypothetical protein  28.89 
 
 		 391 aa  153  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7127  membrane-anchored protein  29.14 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0360  hypothetical protein  29.06 
 
 		 391 aa  152  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3927  hypothetical protein  29.71 
 
 		 402 aa  152  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3905  glycosyltransferase family 28 protein  28.88 
 
 		 401 aa  150  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0957738 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2825  hypothetical protein  32.75 
 
 		 416 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.791946  normal  0.436894 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0614  hypothetical protein  30.75 
 
 		 409 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0765  glycosyl transferase-like protein  30.75 
 
 		 472 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.51798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0204  response regulator receiver protein  30.9 
 
 		 474 aa  113  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7222  RedA-like protein  34.39 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0735  hypothetical protein  24.21 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0358  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  26.53 
 
 		 357 aa  47.8  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7225  Glycosyltransferase 28 domain protein  41.25 
 
 		 671 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498881  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0254  hypothetical protein  27.27 
 
 		 374 aa  45.8  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.965107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0356  hypothetical protein  23.86 
 
 		 386 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3518  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  29.14 
 
 		 356 aa  44.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3387  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  29.14 
 
 		 356 aa  44.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0519  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  27.62 
 
 		 358 aa  43.5  0.009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2918  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  29.14 
 
 		 356 aa  43.1  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>