31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6470 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7222  RedA-like protein  88.75 
 
 		 398 aa  646    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6470  RedA-like protein  100 
 
 		 394 aa  755    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2825  hypothetical protein  56.27 
 
 		 416 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.791946  normal  0.436894 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4596  putative membrane-anchored protein  48.54 
 
 		 404 aa  328  7e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.576563  normal  0.938247 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3688  hypothetical protein  48.28 
 
 		 406 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.112899 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5974  membrane-anchored protein  48.01 
 
 		 401 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.951983  normal  0.842489 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3927  hypothetical protein  47.35 
 
 		 402 aa  306  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7127  membrane-anchored protein  47.21 
 
 		 402 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0739  hypothetical protein  36.88 
 
 		 391 aa  242  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4330  hypothetical protein  35.23 
 
 		 427 aa  232  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0675545 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4270  hypothetical protein  34.97 
 
 		 427 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0360  hypothetical protein  38.04 
 
 		 391 aa  230  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0333  Glycosyltransferase 28 domain protein  36.74 
 
 		 414 aa  224  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3905  glycosyltransferase family 28 protein  38.9 
 
 		 401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0957738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2432  hypothetical protein  37.75 
 
 		 423 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.18236 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1994  putative glycosyltransferase  36.97 
 
 		 386 aa  203  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0252697  normal  0.74194 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0204  response regulator receiver protein  38.48 
 
 		 474 aa  184  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0765  glycosyl transferase-like protein  36.14 
 
 		 472 aa  172  9e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.51798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0614  hypothetical protein  36.14 
 
 		 409 aa  172  9e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01990  predicted glycosyl transferase  33.65 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2799  hypothetical protein  40.76 
 
 		 410 aa  151  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.516994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0254  hypothetical protein  28.16 
 
 		 374 aa  92.8  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.965107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0735  hypothetical protein  29.46 
 
 		 401 aa  89  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3925  hypothetical protein  28.85 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0356  hypothetical protein  26.03 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4598  glycosyltransferase family 28 protein  29.65 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312674  normal  0.707093 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5976  Glycosyltransferase 28 domain  29.54 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211682  normal  0.611684 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7129  Glycosyltransferase 28 domain protein  28.68 
 
 		 381 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.379317 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6473  glycosyltransferase family 28 protein  32.31 
 
 		 671 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0174404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3843  Glycosyltransferase 28 domain protein  26.74 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3692  hypothetical protein  24.1 
 
 		 379 aa  42.7  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.833754 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>