72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3925 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3925  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  733    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7129  Glycosyltransferase 28 domain protein  64.29 
 
 		 381 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.379317 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5976  Glycosyltransferase 28 domain  63.71 
 
 		 382 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211682  normal  0.611684 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4598  glycosyltransferase family 28 protein  60.29 
 
 		 384 aa  364  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312674  normal  0.707093 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2827  glycosyl transferase-like protein  42.06 
 
 		 650 aa  227  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6473  glycosyltransferase family 28 protein  44.35 
 
 		 671 aa  208  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0174404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3692  hypothetical protein  39.1 
 
 		 379 aa  197  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.833754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7225  Glycosyltransferase 28 domain protein  45.8 
 
 		 671 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498881  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0735  hypothetical protein  37.67 
 
 		 401 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0254  hypothetical protein  37.32 
 
 		 374 aa  188  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.965107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0356  hypothetical protein  34.15 
 
 		 386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2358  putative glycosyltransferase protein  33.87 
 
 		 396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0125042  normal  0.920267 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3688  hypothetical protein  28.96 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.112899 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0739  hypothetical protein  23.58 
 
 		 391 aa  106  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3905  glycosyltransferase family 28 protein  24.54 
 
 		 401 aa  103  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0957738 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0333  Glycosyltransferase 28 domain protein  22.64 
 
 		 414 aa  103  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0204  response regulator receiver protein  28.53 
 
 		 474 aa  99.4  9e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4330  hypothetical protein  24.47 
 
 		 427 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0675545 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4270  hypothetical protein  24.2 
 
 		 427 aa  96.3  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2825  hypothetical protein  30.27 
 
 		 416 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.791946  normal  0.436894 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0360  hypothetical protein  22.89 
 
 		 391 aa  94  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4596  putative membrane-anchored protein  26.09 
 
 		 404 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.576563  normal  0.938247 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2432  hypothetical protein  26.39 
 
 		 423 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.18236 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6470  RedA-like protein  28.85 
 
 		 394 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1994  putative glycosyltransferase  27.61 
 
 		 386 aa  90.1  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0252697  normal  0.74194 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0765  glycosyl transferase-like protein  26.26 
 
 		 472 aa  87.4  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.51798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0614  hypothetical protein  26.26 
 
 		 409 aa  87.4  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7222  RedA-like protein  27.42 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3927  hypothetical protein  24.46 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5974  membrane-anchored protein  21.32 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.951983  normal  0.842489 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7127  membrane-anchored protein  21.28 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2799  hypothetical protein  27.92 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.516994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01990  predicted glycosyl transferase  25 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0410  Undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptidebeta- N -acetylglucosaminyltransferase  24.65 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.823553  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1304  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  29.06 
 
 		 367 aa  53.9  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0783  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  28.57 
 
 		 364 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.653399 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0716  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  27.32 
 
 		 339 aa  52.8  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3727  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  32.22 
 
 		 355 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0692  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  27.32 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02731  undecaprenyl-PP-MurNAc-pentapeptide-UDPGlcNAc GlcNAc transferase  26.36 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2107  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  28.29 
 
 		 364 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1564  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  26.36 
 
 		 352 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0675  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  27.51 
 
 		 372 aa  50.1  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3884  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  38.27 
 
 		 381 aa  49.3  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.321848  normal  0.560072 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1080  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  35.23 
 
 		 357 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3911  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  32.86 
 
 		 383 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3827  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  32.86 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3771  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  32.86 
 
 		 383 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.376405  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4157  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  26.46 
 
 		 351 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.780678 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3666  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  37.8 
 
 		 361 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231982  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3487  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  28.11 
 
 		 371 aa  47.4  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4117  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  26.46 
 
 		 351 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1222  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N-acetylglucosaminyltransferase  24.21 
 
 		 342 aa  47.4  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.641747  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1232  glycosyltransferase  19.45 
 
 		 378 aa  46.6  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3947  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  32.89 
 
 		 386 aa  46.2  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2423  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  35.48 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.282018  normal  0.817725 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0693  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  29.19 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.421793 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1495  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  27.13 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.809197  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2147  N-acetylglucosaminyltransferase, MurG  31.4 
 
 		 358 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3506  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  28.7 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4495  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  34.67 
 
 		 362 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2760  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  32 
 
 		 367 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.847601  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0199  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  32 
 
 		 357 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3601  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  25.48 
 
 		 357 aa  44.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.12925  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4365  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N-acetylglucosaminyltransferase  28.17 
 
 		 352 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.467464  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1436  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  30.34 
 
 		 373 aa  44.3  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2636  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N-acetylglucosaminyltransferase  29.84 
 
 		 377 aa  43.5  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4107  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N-acetylglucosaminyltransferase  27.97 
 
 		 352 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02151  undecaprenyl-PP-MurNAc-pentapeptide-UDPGlcNAc GlcNAc transferase  29.27 
 
 		 355 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0682  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  27.04 
 
 		 365 aa  43.1  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0171369 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0412  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  25.56 
 
 		 364 aa  43.1  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0869  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N-acetylglucosaminyltransferase  28.17 
 
 		 352 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>