39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0614 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0765  glycosyl transferase-like protein  99.76 
 
 		 472 aa  822    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.51798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0614  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  823    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0204  response regulator receiver protein  54.17 
 
 		 474 aa  373  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0333  Glycosyltransferase 28 domain protein  37.67 
 
 		 414 aa  261  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0360  hypothetical protein  36.71 
 
 		 391 aa  251  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2432  hypothetical protein  36.87 
 
 		 423 aa  239  5e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.18236 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4270  hypothetical protein  35.03 
 
 		 427 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4330  hypothetical protein  35.28 
 
 		 427 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0675545 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1994  putative glycosyltransferase  38.73 
 
 		 386 aa  218  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0252697  normal  0.74194 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0739  hypothetical protein  34.62 
 
 		 391 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3688  hypothetical protein  38.08 
 
 		 406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.112899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3905  glycosyltransferase family 28 protein  33.76 
 
 		 401 aa  206  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0957738 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2825  hypothetical protein  37.46 
 
 		 416 aa  204  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.791946  normal  0.436894 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7222  RedA-like protein  34.55 
 
 		 398 aa  200  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6470  RedA-like protein  36.14 
 
 		 394 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4596  putative membrane-anchored protein  35.07 
 
 		 404 aa  190  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.576563  normal  0.938247 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3927  hypothetical protein  30.89 
 
 		 402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5974  membrane-anchored protein  32.99 
 
 		 401 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.951983  normal  0.842489 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7127  membrane-anchored protein  32.21 
 
 		 402 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2799  hypothetical protein  36.9 
 
 		 410 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.516994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01990  predicted glycosyl transferase  32.21 
 
 		 461 aa  146  5e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0735  hypothetical protein  28.47 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0254  hypothetical protein  25.95 
 
 		 374 aa  113  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.965107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0356  hypothetical protein  26.08 
 
 		 386 aa  91.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4598  glycosyltransferase family 28 protein  27.16 
 
 		 384 aa  89.7  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312674  normal  0.707093 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5976  Glycosyltransferase 28 domain  26.33 
 
 		 382 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211682  normal  0.611684 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3925  hypothetical protein  26.67 
 
 		 366 aa  86.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7129  Glycosyltransferase 28 domain protein  26.84 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.379317 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3692  hypothetical protein  26.09 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.833754 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2358  putative glycosyltransferase protein  24.58 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0125042  normal  0.920267 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2827  glycosyl transferase-like protein  26.75 
 
 		 650 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6473  glycosyltransferase family 28 protein  29.96 
 
 		 671 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0174404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7225  Glycosyltransferase 28 domain protein  27.92 
 
 		 671 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498881  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2034  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  30.58 
 
 		 357 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0568  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  29.08 
 
 		 355 aa  45.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2320  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  30.58 
 
 		 357 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2407  glycosyltransferase  26.32 
 
 		 383 aa  45.1  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.245126  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0450  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  26.05 
 
 		 374 aa  43.1  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.460183  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3666  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  24.27 
 
 		 361 aa  43.1  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231982  normal  0.103527 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>