43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0204 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0204  response regulator receiver protein  100 
 
 
474 aa  935    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0765  glycosyl transferase-like protein  54.01 
 
 
472 aa  358  8e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.51798  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0614  hypothetical protein  54.17 
 
 
409 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0333  Glycosyltransferase 28 domain protein  36.57 
 
 
414 aa  237  4e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0360  hypothetical protein  33.25 
 
 
391 aa  228  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0739  hypothetical protein  33.33 
 
 
391 aa  225  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2432  hypothetical protein  35.28 
 
 
423 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.18236 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4270  hypothetical protein  34.02 
 
 
427 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4330  hypothetical protein  33.43 
 
 
427 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0675545 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7222  RedA-like protein  38.11 
 
 
398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6470  RedA-like protein  38.03 
 
 
394 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3688  hypothetical protein  36.16 
 
 
406 aa  182  9.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.112899 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1994  putative glycosyltransferase  33.97 
 
 
386 aa  179  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0252697  normal  0.74194 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3905  glycosyltransferase family 28 protein  34.1 
 
 
401 aa  170  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0957738 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2825  hypothetical protein  32.64 
 
 
416 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.791946  normal  0.436894 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4596  putative membrane-anchored protein  30.4 
 
 
404 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.576563  normal  0.938247 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3927  hypothetical protein  28.96 
 
 
402 aa  146  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2799  hypothetical protein  35.42 
 
 
410 aa  145  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.516994  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5974  membrane-anchored protein  28.67 
 
 
401 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.951983  normal  0.842489 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7127  membrane-anchored protein  27.7 
 
 
402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01990  predicted glycosyl transferase  30.66 
 
 
461 aa  106  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5976  Glycosyltransferase 28 domain  28.78 
 
 
382 aa  103  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211682  normal  0.611684 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0735  hypothetical protein  29.28 
 
 
401 aa  100  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7129  Glycosyltransferase 28 domain protein  28.82 
 
 
381 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.379317 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0254  hypothetical protein  25 
 
 
374 aa  97.4  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.965107  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3925  hypothetical protein  27.75 
 
 
366 aa  88.2  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4598  glycosyltransferase family 28 protein  29 
 
 
384 aa  86.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312674  normal  0.707093 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0356  hypothetical protein  25.34 
 
 
386 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2827  glycosyl transferase-like protein  29.14 
 
 
650 aa  70.1  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7225  Glycosyltransferase 28 domain protein  30.04 
 
 
671 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498881  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6473  glycosyltransferase family 28 protein  29.82 
 
 
671 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0174404  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2358  putative glycosyltransferase protein  29.19 
 
 
396 aa  50.4  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0125042  normal  0.920267 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2034  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  26.71 
 
 
357 aa  50.4  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3692  hypothetical protein  25.6 
 
 
379 aa  50.1  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.833754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3875  hypothetical protein  42.65 
 
 
325 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.23354 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1250  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N-acetylglucosaminyltransferase  36.05 
 
 
361 aa  49.3  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.414825  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1080  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  26.25 
 
 
357 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2320  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  26.58 
 
 
357 aa  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1245  Undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptidebeta- N -acetylglucosaminyltransferase  42.31 
 
 
350 aa  46.2  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0774  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  39.19 
 
 
356 aa  45.8  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0722  hypothetical protein  33.33 
 
 
324 aa  44.3  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3911  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  26.79 
 
 
383 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3771  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  26.79 
 
 
383 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.376405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>