34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0735 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0735  hypothetical protein  100 
 
 
401 aa  803    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0356  hypothetical protein  43.85 
 
 
386 aa  292  7e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0254  hypothetical protein  42.6 
 
 
374 aa  271  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.965107  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4598  glycosyltransferase family 28 protein  37.76 
 
 
384 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312674  normal  0.707093 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5976  Glycosyltransferase 28 domain  38.68 
 
 
382 aa  186  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211682  normal  0.611684 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7129  Glycosyltransferase 28 domain protein  38.01 
 
 
381 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.379317 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3925  hypothetical protein  37.67 
 
 
366 aa  175  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2358  putative glycosyltransferase protein  33.08 
 
 
396 aa  140  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0125042  normal  0.920267 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2827  glycosyl transferase-like protein  35.47 
 
 
650 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3692  hypothetical protein  32.32 
 
 
379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.833754 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2432  hypothetical protein  27.53 
 
 
423 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.18236 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1994  putative glycosyltransferase  29.62 
 
 
386 aa  112  8.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0252697  normal  0.74194 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6473  glycosyltransferase family 28 protein  36.57 
 
 
671 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0174404  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0765  glycosyl transferase-like protein  28.46 
 
 
472 aa  103  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.51798  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0614  hypothetical protein  28.47 
 
 
409 aa  103  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4330  hypothetical protein  24.87 
 
 
427 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0675545 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4270  hypothetical protein  24.87 
 
 
427 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0739  hypothetical protein  26.54 
 
 
391 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0204  response regulator receiver protein  30.3 
 
 
474 aa  100  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7225  Glycosyltransferase 28 domain protein  33.92 
 
 
671 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498881  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2825  hypothetical protein  28.38 
 
 
416 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.791946  normal  0.436894 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0360  hypothetical protein  24.66 
 
 
391 aa  94.7  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6470  RedA-like protein  29.9 
 
 
394 aa  89  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0333  Glycosyltransferase 28 domain protein  25.14 
 
 
414 aa  86.7  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7222  RedA-like protein  26.72 
 
 
398 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3688  hypothetical protein  26.33 
 
 
406 aa  85.9  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.112899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3905  glycosyltransferase family 28 protein  25.6 
 
 
401 aa  76.6  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0957738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3868  glycosyltransferase family 28 protein  33.16 
 
 
527 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.479264  normal  0.241184 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7127  membrane-anchored protein  23.92 
 
 
402 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2799  hypothetical protein  28.53 
 
 
410 aa  67  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.516994  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4596  putative membrane-anchored protein  23.63 
 
 
404 aa  66.2  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.576563  normal  0.938247 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3927  hypothetical protein  21.88 
 
 
402 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5974  membrane-anchored protein  23.49 
 
 
401 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.951983  normal  0.842489 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01990  predicted glycosyl transferase  25.33 
 
 
461 aa  57.4  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>