39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0356 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0356  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  775    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0735  hypothetical protein  43.85 
 
 		 401 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0254  hypothetical protein  40.7 
 
 		 374 aa  235  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.965107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7129  Glycosyltransferase 28 domain protein  37.08 
 
 		 381 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.379317 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5976  Glycosyltransferase 28 domain  35.9 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211682  normal  0.611684 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3925  hypothetical protein  34.15 
 
 		 366 aa  156  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4598  glycosyltransferase family 28 protein  33.25 
 
 		 384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312674  normal  0.707093 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3692  hypothetical protein  30.33 
 
 		 379 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.833754 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2358  putative glycosyltransferase protein  31.37 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0125042  normal  0.920267 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2827  glycosyl transferase-like protein  30.6 
 
 		 650 aa  106  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6473  glycosyltransferase family 28 protein  34.17 
 
 		 671 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0174404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7225  Glycosyltransferase 28 domain protein  32.02 
 
 		 671 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498881  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2432  hypothetical protein  27 
 
 		 423 aa  89.4  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.18236 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0614  hypothetical protein  25.07 
 
 		 409 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0765  glycosyl transferase-like protein  25.07 
 
 		 472 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.51798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0360  hypothetical protein  24.66 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0204  response regulator receiver protein  25.07 
 
 		 474 aa  78.2  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6470  RedA-like protein  26.03 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4330  hypothetical protein  23.04 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0675545 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4270  hypothetical protein  22.76 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7222  RedA-like protein  25.35 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4596  putative membrane-anchored protein  24.94 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.576563  normal  0.938247 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1994  putative glycosyltransferase  26.7 
 
 		 386 aa  72.8  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0252697  normal  0.74194 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2825  hypothetical protein  28.57 
 
 		 416 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.791946  normal  0.436894 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0333  Glycosyltransferase 28 domain protein  25.07 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0739  hypothetical protein  24.93 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2799  hypothetical protein  28.16 
 
 		 410 aa  66.2  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.516994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3905  glycosyltransferase family 28 protein  23.48 
 
 		 401 aa  66.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0957738 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3688  hypothetical protein  25.71 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.112899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3868  glycosyltransferase family 28 protein  31.33 
 
 		 527 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.479264  normal  0.241184 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7127  membrane-anchored protein  24.13 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3927  hypothetical protein  22.02 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5974  membrane-anchored protein  22.07 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.951983  normal  0.842489 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02731  undecaprenyl-PP-MurNAc-pentapeptide-UDPGlcNAc GlcNAc transferase  22.75 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1564  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  23.33 
 
 		 352 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2201  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  32.09 
 
 		 366 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.397308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1493  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  26.29 
 
 		 336 aa  44.3  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0427088  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0418  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  25 
 
 		 347 aa  43.5  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00106805  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4935  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 396 aa  42.7  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0247696  normal  0.131407 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>