43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4596 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4596  putative membrane-anchored protein  100 
 
 		 404 aa  824    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.576563  normal  0.938247 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7127  membrane-anchored protein  73.25 
 
 		 402 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5974  membrane-anchored protein  73 
 
 		 401 aa  580  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.951983  normal  0.842489 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3927  hypothetical protein  70.07 
 
 		 402 aa  559  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6470  RedA-like protein  48.41 
 
 		 394 aa  345  6e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7222  RedA-like protein  48.01 
 
 		 398 aa  334  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3688  hypothetical protein  43.33 
 
 		 406 aa  311  2e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.112899 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2825  hypothetical protein  43.05 
 
 		 416 aa  295  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.791946  normal  0.436894 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3905  glycosyltransferase family 28 protein  43.3 
 
 		 401 aa  264  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0957738 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0360  hypothetical protein  38.54 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0333  Glycosyltransferase 28 domain protein  39.37 
 
 		 414 aa  260  3e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4330  hypothetical protein  34.08 
 
 		 427 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0675545 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4270  hypothetical protein  33.83 
 
 		 427 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0739  hypothetical protein  38.73 
 
 		 391 aa  240  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2432  hypothetical protein  38.79 
 
 		 423 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.18236 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1994  putative glycosyltransferase  35.81 
 
 		 386 aa  228  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0252697  normal  0.74194 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0614  hypothetical protein  33.24 
 
 		 409 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0765  glycosyl transferase-like protein  33.24 
 
 		 472 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.51798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2799  hypothetical protein  35.4 
 
 		 410 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.516994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0204  response regulator receiver protein  30.55 
 
 		 474 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01990  predicted glycosyl transferase  30.27 
 
 		 461 aa  161  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0254  hypothetical protein  25.81 
 
 		 374 aa  96.7  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.965107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3925  hypothetical protein  26.09 
 
 		 366 aa  90.1  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5976  Glycosyltransferase 28 domain  26.09 
 
 		 382 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211682  normal  0.611684 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7129  Glycosyltransferase 28 domain protein  27.46 
 
 		 381 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.379317 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4598  glycosyltransferase family 28 protein  26.35 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312674  normal  0.707093 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0356  hypothetical protein  24.94 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0735  hypothetical protein  23.21 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2827  glycosyl transferase-like protein  23.63 
 
 		 650 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3692  hypothetical protein  25.66 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.833754 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2994  monogalactosyldiacylglycerol synthase  32.37 
 
 		 431 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000104311  hitchhiker  0.00600632 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2358  putative glycosyltransferase protein  28.03 
 
 		 396 aa  50.1  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0125042  normal  0.920267 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6473  glycosyltransferase family 28 protein  26.72 
 
 		 671 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0174404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1235  glycosyltransferase family 28 protein  28.18 
 
 		 361 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110659  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2020  monogalactosyldiacylglycerol synthase  31.01 
 
 		 432 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0507  glycosyltransferase family 28 protein  27.27 
 
 		 361 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1401  glycosyltransferase family 28 protein  27.27 
 
 		 361 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7225  Glycosyltransferase 28 domain protein  29.61 
 
 		 671 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498881  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1232  glycosyltransferase  25.47 
 
 		 378 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1522  hypothetical protein  28.14 
 
 		 337 aa  43.5  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00720586  normal  0.955274 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5106  hypothetical protein  27.59 
 
 		 344 aa  43.5  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.126128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1910  glycosyl transferase family 2  23.33 
 
 		 622 aa  43.5  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00799183  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3364  Monogalactosyldiacylglycerol synthase  27.27 
 
 		 379 aa  43.1  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.804764  hitchhiker  0.000516086 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>