30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2825 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2825  hypothetical protein  100 
 
 
416 aa  808    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.791946  normal  0.436894 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6470  RedA-like protein  56.27 
 
 
394 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3688  hypothetical protein  51.66 
 
 
406 aa  354  2e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.112899 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7222  RedA-like protein  55.1 
 
 
398 aa  352  5e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4596  putative membrane-anchored protein  43.05 
 
 
404 aa  279  8e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.576563  normal  0.938247 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7127  membrane-anchored protein  41.16 
 
 
402 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5974  membrane-anchored protein  41.49 
 
 
401 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.951983  normal  0.842489 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3927  hypothetical protein  41.27 
 
 
402 aa  258  9e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0739  hypothetical protein  35.44 
 
 
391 aa  226  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0360  hypothetical protein  39.2 
 
 
391 aa  224  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0333  Glycosyltransferase 28 domain protein  37.28 
 
 
414 aa  219  5e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4330  hypothetical protein  34.57 
 
 
427 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0675545 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4270  hypothetical protein  33.91 
 
 
427 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2432  hypothetical protein  33.17 
 
 
423 aa  186  9e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.18236 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0765  glycosyl transferase-like protein  35.73 
 
 
472 aa  182  7e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.51798  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0614  hypothetical protein  35.73 
 
 
409 aa  182  7e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3905  glycosyltransferase family 28 protein  35.69 
 
 
401 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0957738 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1994  putative glycosyltransferase  36.36 
 
 
386 aa  180  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0252697  normal  0.74194 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2799  hypothetical protein  39.05 
 
 
410 aa  172  7.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.516994  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0204  response regulator receiver protein  32.85 
 
 
474 aa  169  7e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01990  predicted glycosyl transferase  32.75 
 
 
461 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0254  hypothetical protein  27.2 
 
 
374 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.965107  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0735  hypothetical protein  27.79 
 
 
401 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4598  glycosyltransferase family 28 protein  30.42 
 
 
384 aa  86.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312674  normal  0.707093 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3925  hypothetical protein  30.27 
 
 
366 aa  81.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5976  Glycosyltransferase 28 domain  28.78 
 
 
382 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211682  normal  0.611684 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7129  Glycosyltransferase 28 domain protein  27.3 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.379317 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0356  hypothetical protein  28.57 
 
 
386 aa  70.5  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3692  hypothetical protein  28.5 
 
 
379 aa  60.8  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.833754 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2827  glycosyl transferase-like protein  30.35 
 
 
650 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.535834 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>