50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1994 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1994  putative glycosyltransferase  100 
 
 		 386 aa  780    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0252697  normal  0.74194 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2432  hypothetical protein  42.93 
 
 		 423 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.18236 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4330  hypothetical protein  43.45 
 
 		 427 aa  308  9e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0675545 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4270  hypothetical protein  42.9 
 
 		 427 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2799  hypothetical protein  43.79 
 
 		 410 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.516994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4596  putative membrane-anchored protein  35.81 
 
 		 404 aa  215  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.576563  normal  0.938247 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3688  hypothetical protein  38.9 
 
 		 406 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.112899 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6470  RedA-like protein  36.97 
 
 		 394 aa  203  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7127  membrane-anchored protein  31.97 
 
 		 402 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0765  glycosyl transferase-like protein  38.95 
 
 		 472 aa  196  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.51798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0614  hypothetical protein  39.13 
 
 		 409 aa  196  7e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0739  hypothetical protein  33.99 
 
 		 391 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5974  membrane-anchored protein  33.42 
 
 		 401 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.951983  normal  0.842489 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0360  hypothetical protein  33.61 
 
 		 391 aa  193  5e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3927  hypothetical protein  32.21 
 
 		 402 aa  192  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7222  RedA-like protein  36.32 
 
 		 398 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0333  Glycosyltransferase 28 domain protein  33.24 
 
 		 414 aa  190  5e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01990  predicted glycosyl transferase  32.75 
 
 		 461 aa  183  5.0000000000000004e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2825  hypothetical protein  36.36 
 
 		 416 aa  180  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.791946  normal  0.436894 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0204  response regulator receiver protein  33.43 
 
 		 474 aa  179  8e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3905  glycosyltransferase family 28 protein  33.98 
 
 		 401 aa  178  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0957738 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0735  hypothetical protein  29.55 
 
 		 401 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0254  hypothetical protein  28.57 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.965107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5976  Glycosyltransferase 28 domain  27.86 
 
 		 382 aa  86.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211682  normal  0.611684 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3925  hypothetical protein  26.54 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4598  glycosyltransferase family 28 protein  27.69 
 
 		 384 aa  79.7  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312674  normal  0.707093 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7129  Glycosyltransferase 28 domain protein  28.77 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.379317 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2358  putative glycosyltransferase protein  27.61 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0125042  normal  0.920267 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0356  hypothetical protein  26.7 
 
 		 386 aa  72.8  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3692  hypothetical protein  25.97 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.833754 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2827  glycosyl transferase-like protein  29.51 
 
 		 650 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7225  Glycosyltransferase 28 domain protein  32.77 
 
 		 671 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498881  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7443  Glycosyltransferase 28 domain protein  34.35 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296438  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6473  glycosyltransferase family 28 protein  28.03 
 
 		 671 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0174404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1080  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  30 
 
 		 357 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0199  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  30.49 
 
 		 357 aa  46.6  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0774  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  34.38 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2941  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  33.83 
 
 		 369 aa  46.2  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.160396 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0778  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  27.78 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.989407  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3387  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  24.1 
 
 		 356 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0476  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  32.17 
 
 		 358 aa  45.1  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1235  glycosyltransferase family 28 protein  23.26 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110659  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3518  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  24.1 
 
 		 356 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3168  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  33.08 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  0.826654 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6704  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N-acetylglucosaminyltransferase  33.83 
 
 		 372 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0568  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  28.93 
 
 		 355 aa  44.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3666  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  27.82 
 
 		 361 aa  44.3  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231982  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0507  glycosyltransferase family 28 protein  23.26 
 
 		 361 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0063  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  34.34 
 
 		 368 aa  43.5  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2724  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  32.87 
 
 		 366 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.935394  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>