62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6473 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6473  glycosyltransferase family 28 protein  100 
 
 		 671 aa  1241    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0174404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7225  Glycosyltransferase 28 domain protein  74.22 
 
 		 671 aa  754    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498881  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2827  glycosyl transferase-like protein  54.16 
 
 		 650 aa  529  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3692  hypothetical protein  47.88 
 
 		 379 aa  291  4e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.833754 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5976  Glycosyltransferase 28 domain  43.8 
 
 		 382 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211682  normal  0.611684 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7129  Glycosyltransferase 28 domain protein  43.57 
 
 		 381 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.379317 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3925  hypothetical protein  44.92 
 
 		 366 aa  235  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4598  glycosyltransferase family 28 protein  42.22 
 
 		 384 aa  205  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312674  normal  0.707093 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7102  hypothetical protein  42.29 
 
 		 252 aa  162  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.945245 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3693  hypothetical protein  41.42 
 
 		 252 aa  161  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.716866  normal  0.729343 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5958  hypothetical protein  41.15 
 
 		 250 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0659507 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0735  hypothetical protein  36.88 
 
 		 401 aa  141  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4586  polysaccharide deacetylase  35.41 
 
 		 256 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3934  hypothetical protein  40.08 
 
 		 247 aa  140  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0254  hypothetical protein  33.63 
 
 		 374 aa  135  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.965107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0356  hypothetical protein  34.53 
 
 		 386 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2358  putative glycosyltransferase protein  35.64 
 
 		 396 aa  100  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0125042  normal  0.920267 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1765  polysaccharide deacetylase  29.72 
 
 		 283 aa  86.3  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0333  Glycosyltransferase 28 domain protein  23.44 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2724  hypothetical protein  34.67 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.353724 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0360  hypothetical protein  24.47 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0739  hypothetical protein  25.65 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1994  putative glycosyltransferase  28.46 
 
 		 386 aa  73.2  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0252697  normal  0.74194 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4270  hypothetical protein  27.48 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4330  hypothetical protein  27.48 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0675545 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2432  hypothetical protein  26.49 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.18236 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3688  hypothetical protein  27.07 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.112899 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4596  putative membrane-anchored protein  26.24 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.576563  normal  0.938247 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0765  glycosyl transferase-like protein  25.83 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.51798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0614  hypothetical protein  25.83 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2825  hypothetical protein  28.8 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.791946  normal  0.436894 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6470  RedA-like protein  30.19 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0204  response regulator receiver protein  29.64 
 
 		 474 aa  63.2  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7127  membrane-anchored protein  25.27 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5974  membrane-anchored protein  24.54 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.951983  normal  0.842489 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3927  hypothetical protein  25.27 
 
 		 402 aa  56.6  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3905  glycosyltransferase family 28 protein  23.04 
 
 		 401 aa  57  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0957738 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1910  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 		 622 aa  54.7  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00799183  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0410  Undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptidebeta- N -acetylglucosaminyltransferase  26.21 
 
 		 357 aa  53.5  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.823553  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7222  RedA-like protein  29.56 
 
 		 398 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2009  glycosyltransferase  21.97 
 
 		 380 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0518104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2423  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  34.88 
 
 		 369 aa  49.7  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.282018  normal  0.817725 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2760  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  35.65 
 
 		 367 aa  49.3  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.847601  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1277  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N- acetylglucosamine transferase  35 
 
 		 368 aa  49.3  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0783  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  36.61 
 
 		 364 aa  48.5  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.653399 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2107  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  36.61 
 
 		 364 aa  48.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0478  glycosyltransferase family 28 protein  27.32 
 
 		 433 aa  48.1  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0692  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  32.46 
 
 		 375 aa  47  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.727607  normal  0.771852 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0734  hypothetical protein  26.71 
 
 		 275 aa  47  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1222  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N-acetylglucosaminyltransferase  22.3 
 
 		 342 aa  47.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.641747  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0278  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N-acetylglucosaminyltransferase  32.92 
 
 		 394 aa  46.2  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1436  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  33.71 
 
 		 373 aa  45.8  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2861  N-acetylglucosaminyltransferase, MurG  43.24 
 
 		 359 aa  45.8  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.017558  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3629  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  31.58 
 
 		 361 aa  45.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.874565 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2190  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  34.62 
 
 		 364 aa  45.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.45123  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0693  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  29.55 
 
 		 364 aa  44.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.421793 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0675  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  25 
 
 		 372 aa  44.7  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2560  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  23.97 
 
 		 364 aa  44.7  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0738206  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3884  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  38.46 
 
 		 381 aa  44.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.321848  normal  0.560072 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3737  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  23.97 
 
 		 364 aa  44.3  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0884581  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0610  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  28.08 
 
 		 363 aa  43.9  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.428871  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3089  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  36.36 
 
 		 366 aa  43.9  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>