35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0254 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0254  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  758    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.965107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0735  hypothetical protein  42.6 
 
 		 401 aa  279  6e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0356  hypothetical protein  39.05 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4598  glycosyltransferase family 28 protein  37.96 
 
 		 384 aa  179  9e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312674  normal  0.707093 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3925  hypothetical protein  37.25 
 
 		 366 aa  176  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7129  Glycosyltransferase 28 domain protein  36.29 
 
 		 381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.379317 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5976  Glycosyltransferase 28 domain  36.62 
 
 		 382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211682  normal  0.611684 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3692  hypothetical protein  32.59 
 
 		 379 aa  139  7e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.833754 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0333  Glycosyltransferase 28 domain protein  28.45 
 
 		 414 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3688  hypothetical protein  28.57 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.112899 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0360  hypothetical protein  27.25 
 
 		 391 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6473  glycosyltransferase family 28 protein  31.78 
 
 		 671 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0174404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2432  hypothetical protein  28 
 
 		 423 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.18236 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2827  glycosyl transferase-like protein  29.35 
 
 		 650 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2358  putative glycosyltransferase protein  27.5 
 
 		 396 aa  113  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0125042  normal  0.920267 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7225  Glycosyltransferase 28 domain protein  32.54 
 
 		 671 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498881  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4270  hypothetical protein  26.8 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4330  hypothetical protein  26.8 
 
 		 427 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0675545 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0739  hypothetical protein  27.06 
 
 		 391 aa  106  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1994  putative glycosyltransferase  28.1 
 
 		 386 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0252697  normal  0.74194 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0765  glycosyl transferase-like protein  26.24 
 
 		 472 aa  102  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.51798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0614  hypothetical protein  26.24 
 
 		 409 aa  102  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6470  RedA-like protein  28.38 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0204  response regulator receiver protein  25.29 
 
 		 474 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2825  hypothetical protein  28.34 
 
 		 416 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.791946  normal  0.436894 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3905  glycosyltransferase family 28 protein  26.83 
 
 		 401 aa  98.6  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0957738 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7222  RedA-like protein  27.46 
 
 		 398 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4596  putative membrane-anchored protein  25.79 
 
 		 404 aa  92.8  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.576563  normal  0.938247 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2799  hypothetical protein  29.69 
 
 		 410 aa  88.2  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.516994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3927  hypothetical protein  26.87 
 
 		 402 aa  84  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7127  membrane-anchored protein  25.98 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5974  membrane-anchored protein  25.46 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.951983  normal  0.842489 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01990  predicted glycosyl transferase  23.58 
 
 		 461 aa  52.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0478  glycosyltransferase family 28 protein  28.67 
 
 		 433 aa  47.8  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2095  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N- acetylglucosamine transferase  29.76 
 
 		 367 aa  46.2  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.310142  hitchhiker  0.00000372549 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>