20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0145 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0145  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  769    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.472245 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0202  hypothetical protein  97.91 
 
 		 382 aa  753    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.45206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0286  hypothetical protein  90.55 
 
 		 380 aa  666    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1172  hypothetical protein  37.5 
 
 		 357 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.669426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1393  hypothetical protein  37.5 
 
 		 349 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.650924  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1231  hypothetical protein  36.96 
 
 		 349 aa  158  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5106  hypothetical protein  38.08 
 
 		 344 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.126128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3364  hypothetical protein  33.87 
 
 		 339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000469169  normal  0.0159414 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0722  hypothetical protein  32.11 
 
 		 324 aa  99.4  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4442  hypothetical protein  30.68 
 
 		 324 aa  88.6  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19760  predicted glycosyl transferase  30.07 
 
 		 363 aa  79.3  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3875  hypothetical protein  30.06 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.23354 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1245  Undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptidebeta- N -acetylglucosaminyltransferase  31.98 
 
 		 350 aa  51.2  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3868  glycosyltransferase family 28 protein  28.28 
 
 		 527 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.479264  normal  0.241184 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0360  hypothetical protein  23.66 
 
 		 391 aa  48.9  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0333  Glycosyltransferase 28 domain protein  22.94 
 
 		 414 aa  47.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4270  hypothetical protein  28.67 
 
 		 427 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4330  hypothetical protein  28.19 
 
 		 427 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0675545 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3924  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N- acetylglucosamine transferase  30.34 
 
 		 361 aa  43.5  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.186286  normal  0.217907 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2432  hypothetical protein  28.83 
 
 		 423 aa  43.1  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.18236 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>