20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0202 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0145  hypothetical protein  97.91 
 
 		 382 aa  753    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.472245 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0202  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  768    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.45206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0286  hypothetical protein  91.34 
 
 		 380 aa  671    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1172  hypothetical protein  37.78 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.669426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1393  hypothetical protein  37.5 
 
 		 349 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.650924  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1231  hypothetical protein  36.96 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5106  hypothetical protein  37.53 
 
 		 344 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.126128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3364  hypothetical protein  34.19 
 
 		 339 aa  113  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000469169  normal  0.0159414 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0722  hypothetical protein  32.11 
 
 		 324 aa  101  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4442  hypothetical protein  30.81 
 
 		 324 aa  88.2  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19760  predicted glycosyl transferase  30.39 
 
 		 363 aa  80.5  0.00000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3875  hypothetical protein  30.37 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.23354 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1245  Undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptidebeta- N -acetylglucosaminyltransferase  31.67 
 
 		 350 aa  52.8  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3868  glycosyltransferase family 28 protein  28.28 
 
 		 527 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.479264  normal  0.241184 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0333  Glycosyltransferase 28 domain protein  23.51 
 
 		 414 aa  49.7  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0360  hypothetical protein  23.66 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4270  hypothetical protein  28 
 
 		 427 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4330  hypothetical protein  27.52 
 
 		 427 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0675545 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1570  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  30.07 
 
 		 366 aa  43.1  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3924  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N- acetylglucosamine transferase  30.34 
 
 		 361 aa  43.1  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.186286  normal  0.217907 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>