85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0629 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1976  hypothetical protein  62.22 
 
 
747 aa  932    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0629  hypothetical protein  100 
 
 
716 aa  1474    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1742  hypothetical protein  49.29 
 
 
727 aa  699    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1655  hypothetical protein  35.6 
 
 
369 aa  247  6e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.621847 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07100  hypothetical protein  34.05 
 
 
361 aa  238  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1150  hypothetical protein  36.36 
 
 
370 aa  236  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0110  hypothetical protein  32.87 
 
 
359 aa  235  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000391649 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0353  hypothetical protein  32.69 
 
 
371 aa  235  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2075  hypothetical protein  34.25 
 
 
366 aa  234  5e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1763  hypothetical protein  34.99 
 
 
368 aa  232  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.569772  normal  0.24898 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1185  hypothetical protein  32.69 
 
 
358 aa  232  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.355273  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1122  hypothetical protein  34.62 
 
 
366 aa  230  7e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0661  hypothetical protein  32.56 
 
 
383 aa  226  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.030634  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0631  hypothetical protein  32.69 
 
 
369 aa  224  3e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1371  hypothetical protein  34.52 
 
 
360 aa  219  8.999999999999998e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2219  hypothetical protein  32.63 
 
 
371 aa  218  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2273  hypothetical protein  31.32 
 
 
373 aa  217  5e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2558  hypothetical protein  34.32 
 
 
366 aa  217  5e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000293353  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1121  hypothetical protein  35.8 
 
 
327 aa  212  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3434  hypothetical protein  31.93 
 
 
379 aa  209  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0250  hypothetical protein  30.81 
 
 
365 aa  209  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0728462  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1184  hypothetical protein  32.11 
 
 
329 aa  191  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.738501  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1466  hypothetical protein  28.81 
 
 
364 aa  190  5.999999999999999e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07090  hypothetical protein  33.43 
 
 
330 aa  189  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0109  hypothetical protein  31.15 
 
 
327 aa  190  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000123514 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2074  hypothetical protein  35.49 
 
 
333 aa  188  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0352  hypothetical protein  32.2 
 
 
330 aa  187  7e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1372  hypothetical protein  34.58 
 
 
325 aa  179  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2559  hypothetical protein  31.31 
 
 
333 aa  177  5e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.23992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3435  hypothetical protein  31.59 
 
 
368 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0579  hypothetical protein  30.62 
 
 
364 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0660  hypothetical protein  31.48 
 
 
333 aa  169  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00202264  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0249  hypothetical protein  30.67 
 
 
327 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1151  hypothetical protein  31.61 
 
 
328 aa  161  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2220  hypothetical protein  27.66 
 
 
326 aa  157  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1656  hypothetical protein  29.1 
 
 
324 aa  156  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1762  hypothetical protein  29.66 
 
 
323 aa  146  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.851546  normal  0.326658 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2272  hypothetical protein  28.09 
 
 
304 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0202  hypothetical protein  27.22 
 
 
381 aa  131  5.0000000000000004e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.531807 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1325  CoA enzyme activase  27 
 
 
1354 aa  124  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222648  decreased coverage  0.00889318 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0453  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.25 
 
 
1415 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1329  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  22.67 
 
 
1433 aa  120  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1797  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  20.92 
 
 
1416 aa  120  7.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2543  2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  21.31 
 
 
1436 aa  118  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0578  hypothetical protein  25.31 
 
 
313 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1288  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  21.97 
 
 
1420 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173462  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1945  putative activator of (R) -2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  23.35 
 
 
1428 aa  116  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174198  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0627  CoA-substrate-specific enzyme activase  21.02 
 
 
1434 aa  114  8.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03240  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  28.8 
 
 
1500 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.34888  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28100  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  23.31 
 
 
1461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1467  hypothetical protein  26.15 
 
 
292 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3897  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.56 
 
 
1343 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1695  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  21 
 
 
1500 aa  107  9e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.990172  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2933  CoA-substrate-specific enzyme activase  21.11 
 
 
1415 aa  103  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0438  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  25.16 
 
 
1415 aa  103  9e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1539  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  25.61 
 
 
1036 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1710  CoA-substrate-specific enzyme activase  22.05 
 
 
1421 aa  101  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.838446  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1188  CoA-substrate-specific enzyme activase  22.81 
 
 
1444 aa  100  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1829  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  28.79 
 
 
1021 aa  99.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0962666  normal  0.086745 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0203  hypothetical protein  27.38 
 
 
339 aa  99  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.509977 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1945  CoA-substrate-specific enzyme activase  19.73 
 
 
1426 aa  99  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.676499  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2837  CoA-substrate-specific enzyme activase  21.27 
 
 
1431 aa  92.8  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0533668  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3871  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.68 
 
 
1422 aa  90.1  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0317  CoA-substrate-specific enzyme activase  20.63 
 
 
1424 aa  89  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0967  CoA enzyme activase  20.58 
 
 
1503 aa  89  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2697  CoA-substrate-specific enzyme activase  20.16 
 
 
1411 aa  88.6  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.776938  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0435  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.42 
 
 
1406 aa  88.6  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.932842  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3814  CoA enzyme activase  24.3 
 
 
1442 aa  84  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0149  CoA-substrate-specific enzyme activase  20.85 
 
 
1584 aa  82.4  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3958  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.51 
 
 
1437 aa  80.9  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1830  CoA enzyme activase  24.32 
 
 
453 aa  79.3  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0189  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  26.43 
 
 
1414 aa  79.7  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.52072 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1215  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  20.12 
 
 
975 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07240  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  23.49 
 
 
1578 aa  70.9  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1406  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  19.51 
 
 
975 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.25548  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1387  chaperone protein DnaJ  20.43 
 
 
981 aa  67  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04840  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  21.18 
 
 
1661 aa  65.5  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1931  activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  19.83 
 
 
1647 aa  64.3  0.000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2682  CoA-substrate-specific enzyme activase  22.89 
 
 
1563 aa  63.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2597  putative activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  24.83 
 
 
634 aa  58.9  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0729978 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1610  CoA-substrate-specific enzyme activase  20.92 
 
 
1487 aa  58.5  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1473  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  23.31 
 
 
1137 aa  51.2  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1537  hypothetical protein  19.41 
 
 
396 aa  48.5  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1214  hypothetical protein  23.71 
 
 
421 aa  47.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113079  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1405  hypothetical protein  23.2 
 
 
420 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>