57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0631 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0631  hypothetical protein  100 
 
 
369 aa  762    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2075  hypothetical protein  49.3 
 
 
366 aa  363  4e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1371  hypothetical protein  47.91 
 
 
360 aa  360  3e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1122  hypothetical protein  49.16 
 
 
366 aa  358  8e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07100  hypothetical protein  48.04 
 
 
361 aa  348  7e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1185  hypothetical protein  46.67 
 
 
358 aa  341  9e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.355273  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0110  hypothetical protein  41.74 
 
 
359 aa  317  2e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000391649 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1655  hypothetical protein  42.66 
 
 
369 aa  317  3e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.621847 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3434  hypothetical protein  44.08 
 
 
379 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1763  hypothetical protein  42.78 
 
 
368 aa  309  5.9999999999999995e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.569772  normal  0.24898 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0353  hypothetical protein  40.34 
 
 
371 aa  297  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2558  hypothetical protein  40.66 
 
 
366 aa  283  3.0000000000000004e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000293353  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0661  hypothetical protein  36.63 
 
 
383 aa  277  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.030634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1150  hypothetical protein  38.44 
 
 
370 aa  275  9e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0250  hypothetical protein  35.99 
 
 
365 aa  260  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0728462  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2273  hypothetical protein  33.6 
 
 
373 aa  259  6e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1466  hypothetical protein  36.87 
 
 
364 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1976  hypothetical protein  34.53 
 
 
747 aa  242  7.999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1742  hypothetical protein  35.05 
 
 
727 aa  240  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2219  hypothetical protein  32.13 
 
 
371 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0629  hypothetical protein  32.69 
 
 
716 aa  224  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0579  hypothetical protein  33.24 
 
 
364 aa  224  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0202  hypothetical protein  27.37 
 
 
381 aa  150  5e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.531807 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0249  hypothetical protein  23.14 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1184  hypothetical protein  25.85 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.738501  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3871  CoA-substrate-specific enzyme activase  28.24 
 
 
1422 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3814  CoA enzyme activase  26.51 
 
 
1442 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3435  hypothetical protein  23.54 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3958  CoA-substrate-specific enzyme activase  26.1 
 
 
1437 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0453  CoA-substrate-specific enzyme activase  22.88 
 
 
1415 aa  70.1  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0660  hypothetical protein  24.33 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00202264  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0438  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  23.85 
 
 
1415 aa  67  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2220  hypothetical protein  23.77 
 
 
326 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1121  hypothetical protein  21.73 
 
 
327 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07090  hypothetical protein  21.76 
 
 
330 aa  63.9  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1830  CoA enzyme activase  21.39 
 
 
453 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2272  hypothetical protein  22.77 
 
 
304 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2559  hypothetical protein  24.86 
 
 
333 aa  61.2  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.23992  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0109  hypothetical protein  41.27 
 
 
327 aa  60.8  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000123514 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0189  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.09 
 
 
1414 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.52072 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1656  hypothetical protein  21.98 
 
 
324 aa  59.3  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2074  hypothetical protein  32.5 
 
 
333 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1762  hypothetical protein  37.68 
 
 
323 aa  57.8  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.851546  normal  0.326658 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0352  hypothetical protein  23.56 
 
 
330 aa  58.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1151  hypothetical protein  35.9 
 
 
328 aa  52.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1372  hypothetical protein  32.05 
 
 
325 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1188  CoA-substrate-specific enzyme activase  21.79 
 
 
1444 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1610  CoA-substrate-specific enzyme activase  20.53 
 
 
1487 aa  50.4  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0627  CoA-substrate-specific enzyme activase  22.74 
 
 
1434 aa  48.9  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2697  CoA-substrate-specific enzyme activase  20.55 
 
 
1411 aa  47  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.776938  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1931  activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  22.57 
 
 
1647 aa  46.6  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2597  putative activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  20.48 
 
 
634 aa  46.2  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0729978 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1388  hypothetical protein  18.26 
 
 
419 aa  45.8  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28100  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  24.04 
 
 
1461 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1329  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  20.29 
 
 
1433 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0578  hypothetical protein  28.16 
 
 
313 aa  43.5  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0435  CoA-substrate-specific enzyme activase  22.27 
 
 
1406 aa  42.7  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.932842  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>