53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1388 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1388  hypothetical protein  100 
 
 
419 aa  863    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1405  hypothetical protein  52.1 
 
 
420 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147223  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1214  hypothetical protein  52.35 
 
 
421 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113079  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2697  CoA-substrate-specific enzyme activase  47.32 
 
 
1411 aa  394  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.776938  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2837  CoA-substrate-specific enzyme activase  45.12 
 
 
1431 aa  387  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0533668  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2933  CoA-substrate-specific enzyme activase  44.71 
 
 
1415 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04840  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  47.47 
 
 
1661 aa  379  1e-104  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2682  CoA-substrate-specific enzyme activase  46.38 
 
 
1563 aa  377  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1329  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  44.58 
 
 
1433 aa  376  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1945  putative activator of (R) -2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  44.61 
 
 
1428 aa  372  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174198  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1288  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  43.77 
 
 
1420 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173462  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07240  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  46.51 
 
 
1578 aa  362  1e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1945  CoA-substrate-specific enzyme activase  43.84 
 
 
1426 aa  357  9.999999999999999e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.676499  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1695  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  43.93 
 
 
1500 aa  358  9.999999999999999e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.990172  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0435  CoA-substrate-specific enzyme activase  43.49 
 
 
1406 aa  353  2e-96  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.932842  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0317  CoA-substrate-specific enzyme activase  42.13 
 
 
1424 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0149  CoA-substrate-specific enzyme activase  45.04 
 
 
1584 aa  341  2e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1710  CoA-substrate-specific enzyme activase  42.26 
 
 
1421 aa  330  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.838446  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1931  activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  41.94 
 
 
1647 aa  331  2e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1188  CoA-substrate-specific enzyme activase  39.42 
 
 
1444 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1797  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  39.23 
 
 
1416 aa  307  2.0000000000000002e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2543  2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  39.51 
 
 
1436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0967  CoA enzyme activase  35.95 
 
 
1503 aa  259  8e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0627  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.12 
 
 
1434 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28100  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  31.39 
 
 
1461 aa  200  5e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2597  putative activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  22.55 
 
 
634 aa  100  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0729978 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1830  CoA enzyme activase  21.51 
 
 
453 aa  79  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1150  hypothetical protein  21.59 
 
 
370 aa  72.4  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0661  hypothetical protein  25.06 
 
 
383 aa  70.5  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.030634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1371  hypothetical protein  25.4 
 
 
360 aa  64.7  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1763  hypothetical protein  27.54 
 
 
368 aa  60.5  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.569772  normal  0.24898 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1742  hypothetical protein  26.48 
 
 
727 aa  59.3  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3871  CoA-substrate-specific enzyme activase  21.16 
 
 
1422 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0579  hypothetical protein  25.82 
 
 
364 aa  57  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0250  hypothetical protein  25.21 
 
 
365 aa  56.6  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0728462  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2075  hypothetical protein  24.7 
 
 
366 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1537  hypothetical protein  21.9 
 
 
396 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0110  hypothetical protein  23.73 
 
 
359 aa  54.7  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000391649 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0453  CoA-substrate-specific enzyme activase  18 
 
 
1415 aa  54.3  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0438  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  20.38 
 
 
1415 aa  54.3  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1610  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.39 
 
 
1487 aa  53.9  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3814  CoA enzyme activase  20.99 
 
 
1442 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1122  hypothetical protein  24.39 
 
 
366 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2219  hypothetical protein  24.43 
 
 
371 aa  52.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0189  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  21.69 
 
 
1414 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.52072 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1466  hypothetical protein  25.42 
 
 
364 aa  50.1  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2273  hypothetical protein  24.15 
 
 
373 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3958  CoA-substrate-specific enzyme activase  20.69 
 
 
1437 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0631  hypothetical protein  18.26 
 
 
369 aa  45.8  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0353  hypothetical protein  27.35 
 
 
371 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1472  hypothetical protein  27.48 
 
 
577 aa  43.5  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1655  hypothetical protein  21.99 
 
 
369 aa  43.5  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.621847 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1185  hypothetical protein  24.17 
 
 
358 aa  43.5  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.355273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>