210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_28100 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1695  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  35 
 
 		 1500 aa  866    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.990172  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1188  CoA-substrate-specific enzyme activase  36.01 
 
 		 1444 aa  800    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2697  CoA-substrate-specific enzyme activase  35.38 
 
 		 1411 aa  874    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.776938  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0967  CoA enzyme activase  35.05 
 
 		 1503 aa  829    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0627  CoA-substrate-specific enzyme activase  34.83 
 
 		 1434 aa  872    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0435  CoA-substrate-specific enzyme activase  35.62 
 
 		 1406 aa  861    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.932842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1406  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  38.08 
 
 		 975 aa  709    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.25548  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1215  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  37.51 
 
 		 975 aa  709    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1945  putative activator of (R) -2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  36.64 
 
 		 1428 aa  880    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174198  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2543  2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  35.68 
 
 		 1436 aa  860    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0317  CoA-substrate-specific enzyme activase  34.74 
 
 		 1424 aa  842    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0149  CoA-substrate-specific enzyme activase  35.16 
 
 		 1584 aa  837    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1387  chaperone protein DnaJ  37.35 
 
 		 981 aa  654    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1329  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  35.58 
 
 		 1433 aa  882    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04840  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  37.95 
 
 		 1661 aa  664    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1710  CoA-substrate-specific enzyme activase  35.28 
 
 		 1421 aa  810    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.838446  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1288  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  36.61 
 
 		 1420 aa  893    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173462  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2837  CoA-substrate-specific enzyme activase  34.24 
 
 		 1431 aa  826    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0533668  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2682  CoA-substrate-specific enzyme activase  34.36 
 
 		 1563 aa  801    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1945  CoA-substrate-specific enzyme activase  35.55 
 
 		 1426 aa  858    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.676499  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07240  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  38.43 
 
 		 1578 aa  644    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1797  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  33.7 
 
 		 1416 aa  783    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28100  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  100 
 
 		 1461 aa  3026    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2933  CoA-substrate-specific enzyme activase  36.21 
 
 		 1415 aa  886    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1931  activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  35.6 
 
 		 1647 aa  610  1e-173  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2596  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.8 
 
 		 1206 aa  474  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0629261 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1539  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  28.57 
 
 		 1036 aa  410  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1473  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  29.31 
 
 		 1137 aa  394  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1325  CoA enzyme activase  26.66 
 
 		 1354 aa  343  2e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222648  decreased coverage  0.00889318 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3897  CoA-substrate-specific enzyme activase  26.84 
 
 		 1343 aa  339  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0453  CoA-substrate-specific enzyme activase  24.56 
 
 		 1415 aa  320  2e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0438  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  24.64 
 
 		 1415 aa  313  2e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03240  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  27.76 
 
 		 1500 aa  310  1.0000000000000001e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.34888  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1829  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  26.33 
 
 		 1021 aa  281  6e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0962666  normal  0.086745 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3814  CoA enzyme activase  25.24 
 
 		 1442 aa  242  5e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3958  CoA-substrate-specific enzyme activase  26.08 
 
 		 1437 aa  222  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3871  CoA-substrate-specific enzyme activase  26.06 
 
 		 1422 aa  219  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1610  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.19 
 
 		 1487 aa  217  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0189  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  25.5 
 
 		 1414 aa  214  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.52072 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0354  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  34.46 
 
 		 329 aa  202  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1388  hypothetical protein  31.39 
 
 		 419 aa  200  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1405  hypothetical protein  29.38 
 
 		 420 aa  191  9e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147223  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07110  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  34.42 
 
 		 331 aa  191  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1214  hypothetical protein  29.38 
 
 		 421 aa  191  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113079  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1035  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  33.24 
 
 		 327 aa  189  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1465  CoA-substrate-specific enzyme activase  33.64 
 
 		 330 aa  187  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1743  CoA enzyme activase  33.94 
 
 		 339 aa  185  7e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.386364  normal  0.436212 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1977  CoA-substrate-specific enzyme activase  35.49 
 
 		 339 aa  184  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2218  CoA-substrate-specific enzyme activase  34.24 
 
 		 323 aa  183  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0251  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  35.38 
 
 		 320 aa  182  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.013721  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1123  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  35.47 
 
 		 327 aa  182  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0111  CoA-substrate-specific enzyme activase  34.45 
 
 		 324 aa  180  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000233838 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1370  CoA enzyme activase  35.08 
 
 		 319 aa  179  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2557  2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  31.71 
 
 		 320 aa  178  8e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000851772  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3433  CoA-substrate-specific enzyme activase  33.33 
 
 		 344 aa  176  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1149  CoA enzyme activase  33.03 
 
 		 320 aa  175  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0662  CoA-substrate-specific enzyme activase  33.23 
 
 		 319 aa  175  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00950425  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0628  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  34.26 
 
 		 336 aa  173  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0214776  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0580  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.3 
 
 		 367 aa  173  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2076  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.42 
 
 		 329 aa  171  7e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.460545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0632  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  32.83 
 
 		 331 aa  171  9e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0201  CoA-substrate-specific enzyme activase  34.27 
 
 		 347 aa  169  2.9999999999999998e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.655613 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_485  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase  34.56 
 
 		 283 aa  162  4e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0544  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  34.56 
 
 		 283 aa  161  9e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0520  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  33.7 
 
 		 283 aa  155  7e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.211756  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0200  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.08 
 
 		 539 aa  127  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000427749  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1005  CoA enzyme activase  32.17 
 
 		 255 aa  124  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.350991  hitchhiker  0.000148209 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1830  CoA enzyme activase  26.11 
 
 		 453 aa  124  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1310  CoA-substrate-specific enzyme activase  35 
 
 		 253 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3452  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.32 
 
 		 261 aa  124  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2868  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.44 
 
 		 272 aa  119  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1412  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.44 
 
 		 272 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16070  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.68 
 
 		 260 aa  117  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3161  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  33.7 
 
 		 275 aa  116  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0040907  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1906  CoA enzyme activase  29.64 
 
 		 414 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.213547  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1706  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.08 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2438  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.62 
 
 		 417 aa  113  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0629  hypothetical protein  23.11 
 
 		 716 aa  112  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1745  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.11 
 
 		 261 aa  112  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2061  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  28.1 
 
 		 412 aa  112  7.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1693  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.8 
 
 		 250 aa  110  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1898  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.08 
 
 		 539 aa  110  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0272  CoA enzyme activase  30.48 
 
 		 268 aa  110  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.727827  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0604  CoA-substrate-specific enzyme activase  30 
 
 		 246 aa  109  4e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2597  putative activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  22.93 
 
 		 634 aa  108  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0729978 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0387  (R)-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  30.15 
 
 		 249 aa  108  7e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000890821  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2945  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator, putative  30.89 
 
 		 248 aa  108  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1326  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.42 
 
 		 242 aa  108  8e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0887236  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3160  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.06 
 
 		 267 aa  107  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0864  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  33.33 
 
 		 249 aa  107  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2771  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.8 
 
 		 267 aa  106  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2057  CoA enzyme activase  31.68 
 
 		 256 aa  106  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.712882 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0829  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.94 
 
 		 254 aa  105  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428387 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1773  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.06 
 
 		 263 aa  105  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.912116  normal  0.454124 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0089  CoA enzyme activase  30.19 
 
 		 259 aa  105  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0987  CoA-substrate-specific enzyme activase  32 
 
 		 269 aa  105  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.429759 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0118  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.03 
 
 		 267 aa  105  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00112536  hitchhiker  0.00758509 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0893  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  29.63 
 
 		 273 aa  104  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0496  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  29.77 
 
 		 408 aa  103  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1349  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  29.46 
 
 		 242 aa  103  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00045569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>