206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2543 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1945  CoA-substrate-specific enzyme activase  55.33 
 
 		 1426 aa  1626    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.676499  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1695  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  51.81 
 
 		 1500 aa  1520    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.990172  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0967  CoA enzyme activase  41.08 
 
 		 1503 aa  1123    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07240  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  48.66 
 
 		 1578 aa  1410    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1406  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  50.51 
 
 		 975 aa  1013    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.25548  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1215  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  50.35 
 
 		 975 aa  1007    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0149  CoA-substrate-specific enzyme activase  48.39 
 
 		 1584 aa  1397    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0435  CoA-substrate-specific enzyme activase  51.58 
 
 		 1406 aa  1483    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.932842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1945  putative activator of (R) -2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  53.66 
 
 		 1428 aa  1568    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174198  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2543  2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  100 
 
 		 1436 aa  2976    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28100  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  35.74 
 
 		 1461 aa  864    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2933  CoA-substrate-specific enzyme activase  53.52 
 
 		 1415 aa  1540    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1387  chaperone protein DnaJ  50.35 
 
 		 981 aa  1000    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1710  CoA-substrate-specific enzyme activase  53.14 
 
 		 1421 aa  1478    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.838446  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1329  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  55.83 
 
 		 1433 aa  1653    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1288  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  55.24 
 
 		 1420 aa  1596    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173462  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0317  CoA-substrate-specific enzyme activase  48.91 
 
 		 1424 aa  1402    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1931  activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  49.77 
 
 		 1647 aa  1032    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04840  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  50.63 
 
 		 1661 aa  1017    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2697  CoA-substrate-specific enzyme activase  51.65 
 
 		 1411 aa  1457    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.776938  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1797  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  48.73 
 
 		 1416 aa  1363    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1188  CoA-substrate-specific enzyme activase  42.57 
 
 		 1444 aa  1169    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2682  CoA-substrate-specific enzyme activase  48.1 
 
 		 1563 aa  1387    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0627  CoA-substrate-specific enzyme activase  39.64 
 
 		 1434 aa  1055    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2837  CoA-substrate-specific enzyme activase  50.59 
 
 		 1431 aa  1464    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0533668  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2596  CoA-substrate-specific enzyme activase  28.24 
 
 		 1206 aa  394  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0629261 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1473  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  27.82 
 
 		 1137 aa  389  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1539  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  28.32 
 
 		 1036 aa  380  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3897  CoA-substrate-specific enzyme activase  25.97 
 
 		 1343 aa  347  7e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1405  hypothetical protein  41.69 
 
 		 420 aa  323  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147223  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1214  hypothetical protein  41.44 
 
 		 421 aa  322  5e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113079  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1829  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  26.17 
 
 		 1021 aa  321  6e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0962666  normal  0.086745 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0453  CoA-substrate-specific enzyme activase  26.29 
 
 		 1415 aa  319  3e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0438  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  26.37 
 
 		 1415 aa  317  9e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1325  CoA enzyme activase  24.31 
 
 		 1354 aa  316  2.9999999999999996e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222648  decreased coverage  0.00889318 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1388  hypothetical protein  39.51 
 
 		 419 aa  305  5.000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03240  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  25.62 
 
 		 1500 aa  291  5.0000000000000004e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.34888  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3814  CoA enzyme activase  23.4 
 
 		 1442 aa  242  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3871  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.35 
 
 		 1422 aa  236  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3958  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.17 
 
 		 1437 aa  234  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1610  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.48 
 
 		 1487 aa  217  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0189  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  23.58 
 
 		 1414 aa  209  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.52072 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1149  CoA enzyme activase  33.54 
 
 		 320 aa  166  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1370  CoA enzyme activase  32.28 
 
 		 319 aa  164  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0251  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  33.54 
 
 		 320 aa  164  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.013721  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1977  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.07 
 
 		 339 aa  163  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0354  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  32.6 
 
 		 329 aa  163  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2218  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.65 
 
 		 323 aa  162  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2557  2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  31.11 
 
 		 320 aa  160  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000851772  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1743  CoA enzyme activase  31.54 
 
 		 339 aa  159  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.386364  normal  0.436212 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07110  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  32.28 
 
 		 331 aa  159  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0111  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.96 
 
 		 324 aa  157  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000233838 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0201  CoA-substrate-specific enzyme activase  32 
 
 		 347 aa  156  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.655613 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1123  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  35.52 
 
 		 327 aa  155  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1465  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.96 
 
 		 330 aa  155  5.9999999999999996e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0662  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.96 
 
 		 319 aa  153  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00950425  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0628  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.6 
 
 		 336 aa  153  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0214776  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2076  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.11 
 
 		 329 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.460545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3433  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.12 
 
 		 344 aa  150  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1035  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.37 
 
 		 327 aa  148  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0632  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  30.75 
 
 		 331 aa  145  6e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_485  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase  30.92 
 
 		 283 aa  140  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0544  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  30.92 
 
 		 283 aa  139  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0580  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.33 
 
 		 367 aa  140  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0520  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.59 
 
 		 283 aa  135  6e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.211756  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1310  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.52 
 
 		 253 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0864  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  33.21 
 
 		 249 aa  121  9e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0629  hypothetical protein  21.31 
 
 		 716 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2597  putative activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  23.83 
 
 		 634 aa  117  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0729978 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2868  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.8 
 
 		 272 aa  115  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1412  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.43 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0893  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.62 
 
 		 273 aa  110  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2771  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.37 
 
 		 267 aa  110  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1830  CoA enzyme activase  23.64 
 
 		 453 aa  109  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1745  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.65 
 
 		 261 aa  108  9e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0200  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.09 
 
 		 539 aa  107  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000427749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1976  hypothetical protein  22.52 
 
 		 747 aa  106  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0352  hypothetical protein  25.9 
 
 		 330 aa  104  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0387  (R)-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  30.38 
 
 		 249 aa  103  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000890821  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2559  hypothetical protein  26.83 
 
 		 333 aa  102  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.23992  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2057  CoA enzyme activase  30.98 
 
 		 256 aa  100  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.712882 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1898  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  29.23 
 
 		 539 aa  99.4  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16070  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  28.63 
 
 		 260 aa  99  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0090  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.92 
 
 		 253 aa  98.6  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1358  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  28.96 
 
 		 244 aa  97.8  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.512731  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1326  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.03 
 
 		 242 aa  97.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0887236  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1121  hypothetical protein  24.18 
 
 		 327 aa  97.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3161  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  27.55 
 
 		 275 aa  96.3  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0040907  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1706  CoA-substrate-specific enzyme activase  28.74 
 
 		 262 aa  95.9  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3104  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.16 
 
 		 256 aa  95.9  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0118  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.2 
 
 		 267 aa  95.1  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00112536  hitchhiker  0.00758509 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1417  CoA enzyme activase  29.77 
 
 		 260 aa  94.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000376879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0829  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.91 
 
 		 254 aa  94.4  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428387 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3452  CoA-substrate-specific enzyme activase  27.78 
 
 		 261 aa  95.1  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2023  CoA-substrate-specific enzyme activase  28.79 
 
 		 251 aa  93.2  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.124243  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2945  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator, putative  30.53 
 
 		 248 aa  92.8  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3624  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.76 
 
 		 275 aa  91.7  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000071885  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2039  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.59 
 
 		 256 aa  91.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1773  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.84 
 
 		 263 aa  91.3  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.912116  normal  0.454124 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2399  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.46 
 
 		 272 aa  90.1  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>