203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0967 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1695  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  39.75 
 
 
1500 aa  1073    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.990172  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1945  CoA-substrate-specific enzyme activase  40.03 
 
 
1426 aa  1092    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.676499  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0627  CoA-substrate-specific enzyme activase  47.31 
 
 
1434 aa  1373    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0967  CoA enzyme activase  100 
 
 
1503 aa  3113    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28100  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  35.05 
 
 
1461 aa  821    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04840  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  42.17 
 
 
1661 aa  773    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1406  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  42.13 
 
 
975 aa  786    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.25548  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1215  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  41.83 
 
 
975 aa  784    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0149  CoA-substrate-specific enzyme activase  37.95 
 
 
1584 aa  1016    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1710  CoA-substrate-specific enzyme activase  40.68 
 
 
1421 aa  1031    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.838446  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1945  putative activator of (R) -2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  41.78 
 
 
1428 aa  1111    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174198  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2543  2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  41.18 
 
 
1436 aa  1120    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0317  CoA-substrate-specific enzyme activase  39.85 
 
 
1424 aa  1059    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2697  CoA-substrate-specific enzyme activase  38.88 
 
 
1411 aa  1047    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.776938  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2682  CoA-substrate-specific enzyme activase  37.75 
 
 
1563 aa  1004    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1387  chaperone protein DnaJ  45.32 
 
 
981 aa  820    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1329  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  41.13 
 
 
1433 aa  1140    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07240  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  40.78 
 
 
1578 aa  749    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1931  activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  40.49 
 
 
1647 aa  754    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1288  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  40.41 
 
 
1420 aa  1093    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173462  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1188  CoA-substrate-specific enzyme activase  38.73 
 
 
1444 aa  993    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1797  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  39.03 
 
 
1416 aa  1053    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2933  CoA-substrate-specific enzyme activase  40.93 
 
 
1415 aa  1082    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0435  CoA-substrate-specific enzyme activase  40.25 
 
 
1406 aa  1064    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.932842  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2837  CoA-substrate-specific enzyme activase  40.16 
 
 
1431 aa  1039    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0533668  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1539  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  29.68 
 
 
1036 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2596  CoA-substrate-specific enzyme activase  27.49 
 
 
1206 aa  385  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0629261 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0453  CoA-substrate-specific enzyme activase  24.89 
 
 
1415 aa  340  1.9999999999999998e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3897  CoA-substrate-specific enzyme activase  24.83 
 
 
1343 aa  339  2.9999999999999997e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0438  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  25.09 
 
 
1415 aa  335  4e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1325  CoA enzyme activase  25.63 
 
 
1354 aa  330  1.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222648  decreased coverage  0.00889318 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1829  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  27.24 
 
 
1021 aa  318  4e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0962666  normal  0.086745 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03240  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  26.84 
 
 
1500 aa  291  7e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.34888  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3814  CoA enzyme activase  24.85 
 
 
1442 aa  285  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1473  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  29.91 
 
 
1137 aa  283  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1388  hypothetical protein  35.95 
 
 
419 aa  259  3e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1405  hypothetical protein  32.16 
 
 
420 aa  256  3e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147223  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1214  hypothetical protein  32.16 
 
 
421 aa  255  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113079  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3958  CoA-substrate-specific enzyme activase  25.46 
 
 
1437 aa  241  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0189  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  24.09 
 
 
1414 aa  238  6e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.52072 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1610  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.62 
 
 
1487 aa  211  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0354  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  29.8 
 
 
329 aa  166  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3433  CoA-substrate-specific enzyme activase  33.04 
 
 
344 aa  165  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07110  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.11 
 
 
331 aa  164  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1465  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.74 
 
 
330 aa  163  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2218  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.56 
 
 
323 aa  162  6e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0251  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.5 
 
 
320 aa  161  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.013721  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1370  CoA enzyme activase  31.2 
 
 
319 aa  160  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1149  CoA enzyme activase  31.16 
 
 
320 aa  153  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0632  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  30.41 
 
 
331 aa  153  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1123  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.95 
 
 
327 aa  151  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1977  CoA-substrate-specific enzyme activase  33.84 
 
 
339 aa  149  6e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_485  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase  32.82 
 
 
283 aa  148  9e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0544  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  32.82 
 
 
283 aa  147  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0628  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.03 
 
 
336 aa  147  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0214776  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0201  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.5 
 
 
347 aa  147  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.655613 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0662  CoA-substrate-specific enzyme activase  28.24 
 
 
319 aa  147  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00950425  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0111  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.5 
 
 
324 aa  145  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000233838 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1035  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.84 
 
 
327 aa  145  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2076  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.97 
 
 
329 aa  145  8e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.460545  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0580  CoA-substrate-specific enzyme activase  28.84 
 
 
367 aa  144  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1743  CoA enzyme activase  32.95 
 
 
339 aa  144  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.386364  normal  0.436212 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0520  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.89 
 
 
283 aa  142  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.211756  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2557  2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  29.62 
 
 
320 aa  142  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000851772  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16070  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  32.58 
 
 
260 aa  127  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2868  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.62 
 
 
272 aa  125  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1412  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.62 
 
 
272 aa  125  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1310  CoA-substrate-specific enzyme activase  33.58 
 
 
253 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1898  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  33.58 
 
 
539 aa  124  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0200  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.37 
 
 
539 aa  121  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000427749  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1745  CoA-substrate-specific enzyme activase  33.21 
 
 
261 aa  117  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0893  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  29.66 
 
 
273 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0864  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  33.71 
 
 
249 aa  113  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224978  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1005  CoA enzyme activase  32.18 
 
 
255 aa  111  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.350991  hitchhiker  0.000148209 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3160  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  28.78 
 
 
267 aa  110  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3161  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  28.74 
 
 
275 aa  110  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0040907  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2039  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.54 
 
 
256 aa  110  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0387  (R)-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  30.74 
 
 
249 aa  107  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000890821  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1417  CoA enzyme activase  31.56 
 
 
260 aa  107  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000376879  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1121  hypothetical protein  25 
 
 
327 aa  107  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0109  hypothetical protein  26.61 
 
 
327 aa  107  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000123514 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0118  CoA-substrate-specific enzyme activase  29 
 
 
267 aa  106  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00112536  hitchhiker  0.00758509 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0090  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.48 
 
 
253 aa  106  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3452  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.84 
 
 
261 aa  105  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2945  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator, putative  30.15 
 
 
248 aa  103  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0786  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.94 
 
 
274 aa  103  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.260383  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0272  CoA enzyme activase  29.52 
 
 
268 aa  102  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.727827  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1706  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.3 
 
 
262 aa  103  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1099  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.23 
 
 
264 aa  102  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2776  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  32.45 
 
 
272 aa  102  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2023  CoA-substrate-specific enzyme activase  27.82 
 
 
251 aa  101  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.124243  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2057  CoA enzyme activase  30.3 
 
 
256 aa  100  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.712882 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2771  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  29.81 
 
 
267 aa  100  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2772  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.8 
 
 
260 aa  100  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0987  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.87 
 
 
269 aa  100  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.429759 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1184  hypothetical protein  22.59 
 
 
329 aa  100  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.738501  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1656  hypothetical protein  25 
 
 
324 aa  99  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2399  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.65 
 
 
272 aa  99  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0546  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.95 
 
 
263 aa  97.8  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1279  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  29.2 
 
 
255 aa  97.8  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>