59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1830 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1830  CoA enzyme activase  100 
 
 
453 aa  940    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3958  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.91 
 
 
1437 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3871  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.32 
 
 
1422 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3814  CoA enzyme activase  30.23 
 
 
1442 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28100  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  26.11 
 
 
1461 aa  125  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0453  CoA-substrate-specific enzyme activase  25.17 
 
 
1415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0438  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  24.49 
 
 
1415 aa  111  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2543  2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  23.64 
 
 
1436 aa  109  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1188  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.26 
 
 
1444 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1945  CoA-substrate-specific enzyme activase  22.93 
 
 
1426 aa  103  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.676499  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0435  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.38 
 
 
1406 aa  101  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.932842  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0189  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  27.38 
 
 
1414 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.52072 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1610  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.56 
 
 
1487 aa  97.8  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1288  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  23.36 
 
 
1420 aa  97.8  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173462  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2697  CoA-substrate-specific enzyme activase  22.09 
 
 
1411 aa  97.1  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.776938  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2837  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.64 
 
 
1431 aa  95.9  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0533668  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1710  CoA-substrate-specific enzyme activase  22.96 
 
 
1421 aa  95.9  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.838446  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2075  hypothetical protein  26.23 
 
 
366 aa  94.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2597  putative activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  23.15 
 
 
634 aa  94  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0729978 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04840  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  23.35 
 
 
1661 aa  91.3  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1695  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  21.49 
 
 
1500 aa  90.1  8e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.990172  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2933  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.13 
 
 
1415 aa  89.7  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1329  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  21.9 
 
 
1433 aa  87.8  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2682  CoA-substrate-specific enzyme activase  22.32 
 
 
1563 aa  85.5  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07240  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  22.6 
 
 
1578 aa  85.5  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0967  CoA enzyme activase  25.06 
 
 
1503 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1945  putative activator of (R) -2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  26.98 
 
 
1428 aa  83.6  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174198  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1763  hypothetical protein  23.53 
 
 
368 aa  83.2  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.569772  normal  0.24898 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1931  activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  21.73 
 
 
1647 aa  81.6  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1405  hypothetical protein  21.13 
 
 
420 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147223  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1214  hypothetical protein  21.13 
 
 
421 aa  80.5  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113079  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1797  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  21.65 
 
 
1416 aa  80.1  0.00000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1537  hypothetical protein  22.47 
 
 
396 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0629  hypothetical protein  24.32 
 
 
716 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1388  hypothetical protein  21.51 
 
 
419 aa  79  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0317  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.27 
 
 
1424 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0250  hypothetical protein  23.33 
 
 
365 aa  78.2  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0728462  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0661  hypothetical protein  20.96 
 
 
383 aa  77  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.030634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1742  hypothetical protein  24.32 
 
 
727 aa  76.6  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1371  hypothetical protein  23.37 
 
 
360 aa  75.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0149  CoA-substrate-specific enzyme activase  22.58 
 
 
1584 aa  76.3  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2273  hypothetical protein  22.16 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07100  hypothetical protein  24.44 
 
 
361 aa  74.7  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1122  hypothetical protein  24.69 
 
 
366 aa  74.3  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0353  hypothetical protein  21.28 
 
 
371 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1976  hypothetical protein  23.86 
 
 
747 aa  69.3  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0110  hypothetical protein  22.61 
 
 
359 aa  69.7  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000391649 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0627  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.92 
 
 
1434 aa  66.6  0.0000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1466  hypothetical protein  23.18 
 
 
364 aa  64.3  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0579  hypothetical protein  22.81 
 
 
364 aa  63.5  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0631  hypothetical protein  21.39 
 
 
369 aa  62.4  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3434  hypothetical protein  21.33 
 
 
379 aa  61.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1185  hypothetical protein  25.2 
 
 
358 aa  60.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.355273  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1655  hypothetical protein  20.37 
 
 
369 aa  57.4  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.621847 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1150  hypothetical protein  34.83 
 
 
370 aa  56.6  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0202  hypothetical protein  36.67 
 
 
381 aa  51.2  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.531807 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2558  hypothetical protein  32.58 
 
 
366 aa  50.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000293353  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3897  CoA-substrate-specific enzyme activase  22.78 
 
 
1343 aa  46.6  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2219  hypothetical protein  31.03 
 
 
371 aa  44.3  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>