65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0353 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0353  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  752    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2219  hypothetical protein  50.94 
 
 		 371 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2075  hypothetical protein  48.76 
 
 		 366 aa  363  3e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1122  hypothetical protein  46.69 
 
 		 366 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3434  hypothetical protein  46.01 
 
 		 379 aa  339  4e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2273  hypothetical protein  45.96 
 
 		 373 aa  332  5e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07100  hypothetical protein  45.08 
 
 		 361 aa  322  6e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1371  hypothetical protein  45 
 
 		 360 aa  321  1.9999999999999998e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0110  hypothetical protein  41.74 
 
 		 359 aa  308  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000391649 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1466  hypothetical protein  46.43 
 
 		 364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1150  hypothetical protein  40.65 
 
 		 370 aa  301  9e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1655  hypothetical protein  41.62 
 
 		 369 aa  300  3e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.621847 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2558  hypothetical protein  43.37 
 
 		 366 aa  299  5e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000293353  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0631  hypothetical protein  40.34 
 
 		 369 aa  297  2e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1763  hypothetical protein  40.67 
 
 		 368 aa  295  7e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.569772  normal  0.24898 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0661  hypothetical protein  37.47 
 
 		 383 aa  285  8e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.030634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1185  hypothetical protein  40.06 
 
 		 358 aa  281  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.355273  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0250  hypothetical protein  33.97 
 
 		 365 aa  250  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0728462  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1976  hypothetical protein  34.99 
 
 		 747 aa  243  6e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0629  hypothetical protein  32.69 
 
 		 716 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1742  hypothetical protein  32.33 
 
 		 727 aa  217  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0579  hypothetical protein  32.87 
 
 		 364 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0202  hypothetical protein  28.98 
 
 		 381 aa  162  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.531807 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1184  hypothetical protein  26.15 
 
 		 329 aa  89.7  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.738501  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1121  hypothetical protein  25.28 
 
 		 327 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2559  hypothetical protein  27.43 
 
 		 333 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.23992  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07090  hypothetical protein  24.79 
 
 		 330 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1830  CoA enzyme activase  21.28 
 
 		 453 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2597  putative activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  24.03 
 
 		 634 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0729978 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2220  hypothetical protein  23.03 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0660  hypothetical protein  23.92 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00202264  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2074  hypothetical protein  31.79 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0109  hypothetical protein  29.41 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123514 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1151  hypothetical protein  24.29 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0249  hypothetical protein  28.39 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3435  hypothetical protein  28.29 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2697  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.43 
 
 		 1411 aa  65.5  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.776938  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3871  CoA-substrate-specific enzyme activase  22.37 
 
 		 1422 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0627  CoA-substrate-specific enzyme activase  22.52 
 
 		 1434 aa  60.8  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0189  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  23.8 
 
 		 1414 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.52072 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0453  CoA-substrate-specific enzyme activase  22.14 
 
 		 1415 aa  60.5  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2272  hypothetical protein  27.37 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28100  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  25.97 
 
 		 1461 aa  59.7  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3958  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.1 
 
 		 1437 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1329  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  22.42 
 
 		 1433 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3814  CoA enzyme activase  30 
 
 		 1442 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0578  hypothetical protein  23.99 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1762  hypothetical protein  28.57 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.851546  normal  0.326658 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1656  hypothetical protein  21.13 
 
 		 324 aa  55.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0352  hypothetical protein  25.79 
 
 		 330 aa  55.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1610  CoA-substrate-specific enzyme activase  24.8 
 
 		 1487 aa  53.5  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0438  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  22.43 
 
 		 1415 aa  53.1  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2543  2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  24.08 
 
 		 1436 aa  53.1  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1288  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  24.08 
 
 		 1420 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173462  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1537  hypothetical protein  20.27 
 
 		 396 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1372  hypothetical protein  25 
 
 		 325 aa  50.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1797  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  22.14 
 
 		 1416 aa  50.1  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1747  2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase D-component  26.3 
 
 		 339 aa  49.7  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2933  CoA-substrate-specific enzyme activase  22.2 
 
 		 1415 aa  49.7  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0967  CoA enzyme activase  23.87 
 
 		 1503 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0149  CoA-substrate-specific enzyme activase  22.36 
 
 		 1584 aa  47.4  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0203  hypothetical protein  29.57 
 
 		 339 aa  45.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.509977 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1388  hypothetical protein  27.35 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1710  CoA-substrate-specific enzyme activase  22.07 
 
 		 1421 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.838446  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1931  activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  26.36 
 
 		 1647 aa  43.9  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>